More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00660 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  95.41 
 
 		 554 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  100 
 
 		 477 aa  984    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  92.33 
 
 		 1411 aa  651    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  96.62 
 
 		 1377 aa  657    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  93.51 
 
 		 1411 aa  657    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  99.37 
 
 		 477 aa  981    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  95.11 
 
 		 1397 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  96.94 
 
 		 1397 aa  662    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  98.95 
 
 		 477 aa  974    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  95.08 
 
 		 1394 aa  646    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  98.95 
 
 		 477 aa  977    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  93.51 
 
 		 1411 aa  654    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  94.79 
 
 		 1388 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  984    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  92.92 
 
 		 1411 aa  655    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  100 
 
 		 477 aa  984    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  96.92 
 
 		 1377 aa  658    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  96.02 
 
 		 1397 aa  657    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  92.63 
 
 		 1411 aa  653    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  95.72 
 
 		 1397 aa  657    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  98.11 
 
 		 1399 aa  978    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  95.4 
 
 		 1409 aa  649    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  92.33 
 
 		 1411 aa  651    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  96 
 
 		 1308 aa  654    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  86.77 
 
 		 1365 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  77.01 
 
 		 1426 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  78.15 
 
 		 1200 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  77.01 
 
 		 1426 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  77.01 
 
 		 1426 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  76.72 
 
 		 1429 aa  545  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  78.15 
 
 		 682 aa  543  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  78.15 
 
 		 1216 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  78.7 
 
 		 586 aa  541  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  77.61 
 
 		 1268 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  77.91 
 
 		 1251 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  76.85 
 
 		 1415 aa  533  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  76.92 
 
 		 1398 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  76.52 
 
 		 1400 aa  532  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  78.4 
 
 		 1199 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  76.22 
 
 		 1405 aa  531  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  72.22 
 
 		 1417 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  71.38 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  70.99 
 
 		 1410 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  67.54 
 
 		 1388 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  67.96 
 
 		 1405 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  91.5 
 
 		 314 aa  302  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  91.5 
 
 		 314 aa  302  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  90.85 
 
 		 314 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  90.85 
 
 		 233 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  91.39 
 
 		 312 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  35.41 
 
 		 1490 aa  201  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  36.34 
 
 		 1525 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  35.1 
 
 		 1509 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  34.17 
 
 		 1528 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  34.6 
 
 		 1677 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  34.02 
 
 		 1770 aa  167  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  33.7 
 
 		 1679 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  66.07 
 
 		 713 aa  154  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  32.97 
 
 		 1791 aa  152  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00450  conserved protein, rhs-like protein  73.4 
 
 		 236 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3111  RHS protein  73.4 
 
 		 236 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.791839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00455  hypothetical protein  73.4 
 
 		 236 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0538  Rhs domain-containing protein  73.4 
 
 		 236 aa  150  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  31.54 
 
 		 1609 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  29.5 
 
 		 1547 aa  127  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  35.69 
 
 		 1317 aa  126  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  29.97 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  30.97 
 
 		 1573 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  30.41 
 
 		 1626 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  28.88 
 
 		 1583 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  32.52 
 
 		 1362 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  31.43 
 
 		 1434 aa  120  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03448  rhsA element core protein RshA  91.53 
 
 		 290 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03399  hypothetical protein  91.53 
 
 		 290 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  31.48 
 
 		 1602 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  27.41 
 
 		 598 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  27.91 
 
 		 583 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  28.44 
 
 		 1520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1551 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1604 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  39.87 
 
 		 1348 aa  107  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  45.13 
 
 		 1560 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.93 
 
 		 1527 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  39.83 
 
 		 561 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  39.07 
 
 		 451 aa  106  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  41.88 
 
 		 1400 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  43.8 
 
 		 866 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  44.54 
 
 		 1409 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  29.01 
 
 		 1576 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  47.71 
 
 		 1492 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0770  YD repeat-containing protein  47.71 
 
 		 693 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163533  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  44.95 
 
 		 1611 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1654 aa  103  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  44.14 
 
 		 1550 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  37.01 
 
 		 1411 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  46.3 
 
 		 1466 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  42.15 
 
 		 1620 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0772  RHS protein  46.3 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.728642  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  47.71 
 
 		 1531 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>