More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2201 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  97.46 
 
 		 1426 aa  2472    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  84.7 
 
 		 586 aa  771    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  96.96 
 
 		 1200 aa  2055    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  77.46 
 
 		 1411 aa  1992    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  77.02 
 
 		 1377 aa  1981    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  77.14 
 
 		 1411 aa  1981    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  95.49 
 
 		 682 aa  1056    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  76.7 
 
 		 1397 aa  1979    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  76.42 
 
 		 1410 aa  1959    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  96.9 
 
 		 1426 aa  2461    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  81.14 
 
 		 1199 aa  1773    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  75.91 
 
 		 1417 aa  1942    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1268 aa  2573    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  77.46 
 
 		 1411 aa  1992    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  75.75 
 
 		 713 aa  756    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  69.08 
 
 		 1405 aa  1765    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  76.73 
 
 		 1394 aa  1976    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  81.01 
 
 		 1415 aa  2088    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  76.45 
 
 		 1399 aa  1969    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  77.22 
 
 		 1411 aa  1989    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  76.65 
 
 		 1409 aa  1969    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  77.1 
 
 		 1397 aa  1988    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  97.1 
 
 		 1216 aa  2089    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  76.75 
 
 		 1411 aa  1974    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  82.7 
 
 		 1251 aa  2126    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  76.65 
 
 		 1388 aa  1968    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  69.3 
 
 		 1388 aa  1772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  95.24 
 
 		 1429 aa  2454    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  93.83 
 
 		 1405 aa  2418    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  77.38 
 
 		 1411 aa  1994    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  75.69 
 
 		 1365 aa  1924    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  77.1 
 
 		 1397 aa  1988    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  93.98 
 
 		 1398 aa  2406    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  76.36 
 
 		 1308 aa  1970    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  76.47 
 
 		 1377 aa  1969    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  93.91 
 
 		 1400 aa  2405    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  97.46 
 
 		 1426 aa  2472    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  76.55 
 
 		 1397 aa  1971    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  38.53 
 
 		 1490 aa  749    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  34.03 
 
 		 1525 aa  631  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  34.26 
 
 		 1509 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  34.24 
 
 		 1528 aa  625  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  75.97 
 
 		 554 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  78 
 
 		 502 aa  572  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  78.53 
 
 		 477 aa  545  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  78.53 
 
 		 477 aa  545  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  78.22 
 
 		 477 aa  543  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  77.61 
 
 		 477 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  77.61 
 
 		 477 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  77.61 
 
 		 477 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  30.06 
 
 		 1677 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  32.83 
 
 		 1319 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  32.02 
 
 		 1317 aa  436  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  34.81 
 
 		 1679 aa  362  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  33.41 
 
 		 1791 aa  354  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  34.07 
 
 		 1770 aa  353  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  29.45 
 
 		 1547 aa  324  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1583 aa  315  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  27.42 
 
 		 1604 aa  308  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  29.09 
 
 		 1586 aa  308  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1554 aa  305  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  28.77 
 
 		 1626 aa  303  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1520 aa  300  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  28.76 
 
 		 1620 aa  300  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  28.09 
 
 		 1527 aa  291  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  29.58 
 
 		 1560 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  28.29 
 
 		 1550 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1551 aa  288  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  28.49 
 
 		 1609 aa  287  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  29.05 
 
 		 1981 aa  264  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  76.32 
 
 		 314 aa  254  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  76.32 
 
 		 314 aa  254  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  75.66 
 
 		 233 aa  253  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  75.66 
 
 		 314 aa  253  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.46 
 
 		 1528 aa  250  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  76.67 
 
 		 312 aa  250  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  29.21 
 
 		 1429 aa  248  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  28.98 
 
 		 1379 aa  247  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  27.78 
 
 		 1348 aa  244  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  27.66 
 
 		 1434 aa  238  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1602 aa  237  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  30.29 
 
 		 1385 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  28.45 
 
 		 1419 aa  236  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  25.11 
 
 		 1421 aa  234  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  30.17 
 
 		 1400 aa  231  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  29.32 
 
 		 1229 aa  231  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  26.67 
 
 		 1530 aa  224  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.9 
 
 		 1543 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1552 aa  222  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1411 aa  220  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1466 aa  216  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1492 aa  216  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  29.38 
 
 		 1362 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.65 
 
 		 2096 aa  210  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1409 aa  207  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  31.34 
 
 		 1568 aa  207  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1418 aa  207  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  27.56 
 
 		 1410 aa  206  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  27.79 
 
 		 1573 aa  206  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  24.83 
 
 		 1654 aa  206  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>