More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0299 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  34.52 
 
 		 1411 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  34.7 
 
 		 1397 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  34.57 
 
 		 1377 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  34.59 
 
 		 1411 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  41.27 
 
 		 1679 aa  910    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1411 aa  637    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  34.62 
 
 		 1399 aa  644    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  34.62 
 
 		 1397 aa  643    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1525 aa  3114    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  34.44 
 
 		 1394 aa  638    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  34.43 
 
 		 1397 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  95.29 
 
 		 1528 aa  2667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  40.21 
 
 		 1677 aa  857    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  88.8 
 
 		 1509 aa  2670    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  37.38 
 
 		 1791 aa  828    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  37.76 
 
 		 1770 aa  865    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  34.66 
 
 		 1411 aa  636  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  34.36 
 
 		 1377 aa  634  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  34.54 
 
 		 1409 aa  634  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  34.43 
 
 		 1411 aa  634  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  34.52 
 
 		 1397 aa  630  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  34.09 
 
 		 1426 aa  632  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  34.36 
 
 		 1411 aa  630  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  34.45 
 
 		 1398 aa  633  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  34.09 
 
 		 1426 aa  629  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  34.03 
 
 		 1268 aa  629  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  34.76 
 
 		 1400 aa  629  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1426 aa  629  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  34.31 
 
 		 1308 aa  629  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  36.3 
 
 		 1490 aa  625  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  34.17 
 
 		 1388 aa  625  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  34.05 
 
 		 1410 aa  620  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  33.2 
 
 		 1429 aa  622  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  33.66 
 
 		 1405 aa  616  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  33.43 
 
 		 1251 aa  615  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  33.84 
 
 		 1365 aa  615  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  33.75 
 
 		 1417 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  33.38 
 
 		 1405 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  33.45 
 
 		 1388 aa  592  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  32.87 
 
 		 1415 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  35.32 
 
 		 1317 aa  559  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1319 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1216 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  33.28 
 
 		 1200 aa  505  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  32.08 
 
 		 1199 aa  503  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  29.44 
 
 		 1586 aa  351  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  29.06 
 
 		 1604 aa  344  7e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  28.37 
 
 		 1583 aa  330  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1620 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  28.16 
 
 		 1626 aa  325  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  29.03 
 
 		 1609 aa  311  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  28.88 
 
 		 1348 aa  299  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.8 
 
 		 1362 aa  290  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  27.91 
 
 		 1446 aa  277  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  30.07 
 
 		 1602 aa  277  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1419 aa  276  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  26.85 
 
 		 1654 aa  274  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  27.72 
 
 		 1421 aa  273  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  28.11 
 
 		 1531 aa  269  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  29.59 
 
 		 1981 aa  265  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  29.1 
 
 		 1554 aa  264  8.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  29.66 
 
 		 1530 aa  264  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1400 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_003296  RS00908  putative RSH-related protein  50.19 
 
 		 319 aa  255  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.303359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  27.04 
 
 		 1385 aa  254  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  36.16 
 
 		 713 aa  253  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  29.33 
 
 		 1429 aa  250  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  26.76 
 
 		 1379 aa  249  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  28.65 
 
 		 1411 aa  245  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  27.39 
 
 		 1229 aa  239  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  26.07 
 
 		 1593 aa  239  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  31.73 
 
 		 682 aa  237  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1547 aa  236  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  28.08 
 
 		 1560 aa  234  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  26.74 
 
 		 1434 aa  233  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1410 aa  226  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1550 aa  220  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1386 aa  220  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  26.28 
 
 		 1520 aa  215  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1409 aa  211  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  26.51 
 
 		 1551 aa  207  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1527 aa  205  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.45 
 
 		 1568 aa  197  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  33.7 
 
 		 554 aa  196  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  32.99 
 
 		 586 aa  196  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  24.02 
 
 		 1428 aa  195  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  22.13 
 
 		 2096 aa  195  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  36.06 
 
 		 477 aa  194  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  28.34 
 
 		 866 aa  194  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  36.34 
 
 		 477 aa  194  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  36.34 
 
 		 477 aa  194  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  36.34 
 
 		 477 aa  194  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  36.34 
 
 		 477 aa  194  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  36.34 
 
 		 477 aa  193  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  33.03 
 
 		 502 aa  188  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.68 
 
 		 1485 aa  186  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  23.24 
 
 		 1579 aa  186  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  26.96 
 
 		 1140 aa  186  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.25 
 
 		 1418 aa  185  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  26.04 
 
 		 1573 aa  185  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>