More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4283 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  74.85 
 
 		 1791 aa  2298    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  42.32 
 
 		 1528 aa  1051    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  41.4 
 
 		 1525 aa  920    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1679 aa  3403    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  41.37 
 
 		 1509 aa  907    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  76.46 
 
 		 1770 aa  2344    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  78.01 
 
 		 1677 aa  2340    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  32.36 
 
 		 1490 aa  491  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  35.54 
 
 		 1398 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  35.83 
 
 		 1400 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  35.3 
 
 		 1405 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  34.73 
 
 		 1251 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  34.88 
 
 		 1410 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  35.5 
 
 		 1429 aa  374  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  35.27 
 
 		 1417 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  36.06 
 
 		 1426 aa  367  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  35.31 
 
 		 1268 aa  367  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  36.06 
 
 		 1426 aa  367  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  35.62 
 
 		 1426 aa  365  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  36.4 
 
 		 1388 aa  365  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  34.66 
 
 		 1399 aa  361  6e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  34.66 
 
 		 1394 aa  360  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  34.66 
 
 		 1409 aa  359  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  34.66 
 
 		 1397 aa  358  5.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  35.27 
 
 		 1411 aa  357  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  35.27 
 
 		 1397 aa  356  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  34.3 
 
 		 1388 aa  355  4e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  34.54 
 
 		 1411 aa  355  5e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  34.54 
 
 		 1411 aa  355  5e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  34.3 
 
 		 1411 aa  355  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  34.3 
 
 		 1411 aa  355  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  34.93 
 
 		 1405 aa  355  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  34.3 
 
 		 1308 aa  354  8e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  34.54 
 
 		 1397 aa  353  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  34.54 
 
 		 1377 aa  353  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  34.54 
 
 		 1411 aa  353  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  34.66 
 
 		 1365 aa  353  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  35.02 
 
 		 1377 aa  352  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  34.54 
 
 		 1397 aa  350  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  34.76 
 
 		 1415 aa  348  6e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  28 
 
 		 1583 aa  333  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1317 aa  268  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  36.27 
 
 		 713 aa  265  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  28.55 
 
 		 1319 aa  261  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1216 aa  242  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  25.98 
 
 		 1200 aa  241  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  25.63 
 
 		 1199 aa  228  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  25.94 
 
 		 1626 aa  213  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  26.38 
 
 		 1620 aa  213  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  28.27 
 
 		 682 aa  205  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1604 aa  204  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  31.61 
 
 		 586 aa  178  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1602 aa  177  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1586 aa  175  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  31.03 
 
 		 554 aa  167  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  25.72 
 
 		 1654 aa  166  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  34.45 
 
 		 477 aa  165  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  34.45 
 
 		 477 aa  162  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  34.45 
 
 		 477 aa  162  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  33.7 
 
 		 477 aa  161  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  33.7 
 
 		 477 aa  161  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  33.7 
 
 		 477 aa  161  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.09 
 
 		 1362 aa  157  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  28.31 
 
 		 502 aa  157  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.49 
 
 		 2035 aa  154  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.97 
 
 		 2277 aa  152  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  24.97 
 
 		 1446 aa  148  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.7 
 
 		 1609 aa  144  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1531 aa  144  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  26.3 
 
 		 1560 aa  143  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  25.49 
 
 		 1410 aa  142  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  23.01 
 
 		 1229 aa  141  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  29.88 
 
 		 1981 aa  140  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1547 aa  139  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1527 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1551 aa  136  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  30.11 
 
 		 1554 aa  135  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1520 aa  133  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1550 aa  133  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  28 
 
 		 1429 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1409 aa  132  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03448  rhsA element core protein RshA  57.89 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03399  hypothetical protein  57.89 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  56.31 
 
 		 171 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.9 
 
 		 3027 aa  129  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  42.14 
 
 		 1411 aa  127  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  52.73 
 
 		 451 aa  127  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  23.1 
 
 		 1400 aa  126  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  38.07 
 
 		 561 aa  125  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  48.76 
 
 		 867 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  29.21 
 
 		 1485 aa  123  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  26.04 
 
 		 1530 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3796  YD repeat-containing protein  33.13 
 
 		 422 aa  122  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.982597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.05 
 
 		 1595 aa  122  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  22.97 
 
 		 1586 aa  122  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  24.15 
 
 		 866 aa  122  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1419 aa  119  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  27.32 
 
 		 1348 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  26.62 
 
 		 1573 aa  119  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.7 
 
 		 1576 aa  118  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>