More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3712 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  38.37 
 
 		 1426 aa  749    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  37 
 
 		 1411 aa  754    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  37.4 
 
 		 1410 aa  743    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  37.51 
 
 		 1377 aa  758    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  37.07 
 
 		 1411 aa  757    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  36.92 
 
 		 1397 aa  743    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  38.37 
 
 		 1426 aa  753    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  36.72 
 
 		 1411 aa  744    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  36.49 
 
 		 1365 aa  706    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  37.06 
 
 		 1417 aa  734    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  36.91 
 
 		 1415 aa  719    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  37.15 
 
 		 1388 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  36.72 
 
 		 1411 aa  746    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  36.99 
 
 		 1399 aa  752    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  37.28 
 
 		 1397 aa  748    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  36.86 
 
 		 1411 aa  749    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  38.29 
 
 		 1429 aa  742    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  37.88 
 
 		 1405 aa  735    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  36.62 
 
 		 1251 aa  707    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  38.37 
 
 		 1426 aa  749    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1490 aa  2976    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  37.21 
 
 		 1409 aa  749    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  36.74 
 
 		 1528 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  37.06 
 
 		 1394 aa  744    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  37.25 
 
 		 1308 aa  755    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  37 
 
 		 1411 aa  754    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  37.21 
 
 		 1397 aa  751    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  37.13 
 
 		 1388 aa  754    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  37.08 
 
 		 1377 aa  742    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  38.39 
 
 		 1268 aa  747    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  37.98 
 
 		 1400 aa  734    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  37.87 
 
 		 1398 aa  730    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1405 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  37 
 
 		 1397 aa  743    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  36.45 
 
 		 1509 aa  636  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  36.38 
 
 		 1525 aa  624  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  35.91 
 
 		 1216 aa  551  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  35.84 
 
 		 1200 aa  547  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  33.35 
 
 		 1679 aa  542  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  33.47 
 
 		 1199 aa  515  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  32.3 
 
 		 1677 aa  476  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  33.14 
 
 		 1317 aa  429  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1319 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  43.07 
 
 		 713 aa  365  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  36.56 
 
 		 1770 aa  358  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  36.19 
 
 		 1791 aa  353  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  30.52 
 
 		 1609 aa  322  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  32.04 
 
 		 1626 aa  308  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1547 aa  301  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  30.34 
 
 		 1586 aa  295  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  29.36 
 
 		 1520 aa  295  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  29.57 
 
 		 1551 aa  293  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  28.79 
 
 		 1620 aa  288  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1583 aa  286  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  29.21 
 
 		 1550 aa  284  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  28.79 
 
 		 1527 aa  283  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  28.2 
 
 		 1573 aa  281  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  29.22 
 
 		 1560 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  28.06 
 
 		 1604 aa  263  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  35.68 
 
 		 682 aa  263  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  28.33 
 
 		 1554 aa  252  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  27.19 
 
 		 1411 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  27.71 
 
 		 1446 aa  224  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  27.13 
 
 		 1386 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.05 
 
 		 1362 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  27.76 
 
 		 1434 aa  213  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.32 
 
 		 2096 aa  211  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  27 
 
 		 1385 aa  207  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  28.7 
 
 		 1602 aa  207  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  26.58 
 
 		 1530 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1229 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1400 aa  202  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  35.41 
 
 		 477 aa  201  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  35.41 
 
 		 477 aa  201  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  35.41 
 
 		 477 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  34.75 
 
 		 586 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  35.41 
 
 		 477 aa  201  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  35.41 
 
 		 477 aa  201  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  35.53 
 
 		 554 aa  200  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  35.41 
 
 		 477 aa  200  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1409 aa  198  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  29.74 
 
 		 1429 aa  195  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  28.69 
 
 		 1421 aa  192  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  27.7 
 
 		 1981 aa  191  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  27.41 
 
 		 1140 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  27.72 
 
 		 1348 aa  188  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  27.13 
 
 		 1593 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.14 
 
 		 1586 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  30.02 
 
 		 598 aa  187  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  27.02 
 
 		 1654 aa  187  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  38.86 
 
 		 502 aa  186  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1531 aa  186  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.94 
 
 		 1259 aa  186  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  28.83 
 
 		 1410 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  26.54 
 
 		 866 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1419 aa  181  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  27.94 
 
 		 1379 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.85 
 
 		 1595 aa  174  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  26.73 
 
 		 867 aa  174  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  30.26 
 
 		 583 aa  173  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>