More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3178 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  62.03 
 
 
775 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  61.85 
 
 
775 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  61.85 
 
 
775 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  61.85 
 
 
775 aa  697    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  62.03 
 
 
775 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  62.21 
 
 
775 aa  703    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  61.85 
 
 
775 aa  697    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  89.82 
 
 
1429 aa  2404    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  90.22 
 
 
540 aa  964    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  51.68 
 
 
714 aa  750    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  55.42 
 
 
725 aa  795    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  51.98 
 
 
724 aa  741    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  64.79 
 
 
676 aa  764    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 
1981 aa  4090    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  46.95 
 
 
794 aa  548  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  44.07 
 
 
916 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  44.07 
 
 
874 aa  544  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  44.07 
 
 
922 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  44.36 
 
 
1057 aa  532  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  33.6 
 
 
1586 aa  533  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  46.73 
 
 
896 aa  526  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  46.73 
 
 
858 aa  526  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  46.73 
 
 
930 aa  526  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  46.73 
 
 
872 aa  526  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  43.59 
 
 
1048 aa  515  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  32.97 
 
 
1560 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  33.91 
 
 
1554 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  41.94 
 
 
730 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  41.94 
 
 
729 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  42.09 
 
 
729 aa  497  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  33.59 
 
 
1547 aa  493  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  33.5 
 
 
1520 aa  493  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  33.1 
 
 
1527 aa  489  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  45.73 
 
 
743 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  33.48 
 
 
1319 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  32.69 
 
 
1573 aa  476  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  32.52 
 
 
1550 aa  470  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  35.06 
 
 
1602 aa  470  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  32.77 
 
 
1317 aa  467  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  31.84 
 
 
1609 aa  455  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  32.28 
 
 
1626 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  38.17 
 
 
689 aa  446  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  34.37 
 
 
907 aa  445  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  36.69 
 
 
748 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  38.82 
 
 
778 aa  442  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  38.51 
 
 
794 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  36.71 
 
 
774 aa  439  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  34.64 
 
 
792 aa  440  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  34.18 
 
 
741 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  38.43 
 
 
689 aa  440  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  35.97 
 
 
788 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  40.3 
 
 
734 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  40.3 
 
 
734 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  40.41 
 
 
730 aa  436  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  40.3 
 
 
731 aa  435  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  40.3 
 
 
734 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  37.26 
 
 
756 aa  436  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  39.23 
 
 
741 aa  436  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  40.3 
 
 
734 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  40.3 
 
 
734 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  40.27 
 
 
734 aa  434  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  37.21 
 
 
755 aa  434  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  39.57 
 
 
731 aa  432  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  36.83 
 
 
785 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  31.36 
 
 
1446 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  38.46 
 
 
741 aa  429  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  37.16 
 
 
734 aa  429  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  37.01 
 
 
734 aa  426  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  35.6 
 
 
771 aa  423  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  44.11 
 
 
780 aa  424  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  40.11 
 
 
572 aa  423  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  39.64 
 
 
757 aa  417  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  39.71 
 
 
643 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  40.7 
 
 
1048 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  43.27 
 
 
845 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  40.33 
 
 
646 aa  413  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  39.41 
 
 
777 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  41.33 
 
 
822 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  42.19 
 
 
845 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  41.35 
 
 
841 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  41.27 
 
 
838 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  42.3 
 
 
826 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  41.07 
 
 
841 aa  400  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  41.07 
 
 
841 aa  400  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  41.29 
 
 
843 aa  396  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  30.11 
 
 
1421 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  40.6 
 
 
796 aa  393  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  30.55 
 
 
1362 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  30.36 
 
 
1409 aa  390  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  29.74 
 
 
1411 aa  387  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  29.71 
 
 
1551 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  29.97 
 
 
1611 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  34.48 
 
 
712 aa  382  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  41.17 
 
 
862 aa  382  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  29.7 
 
 
1386 aa  384  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  30.31 
 
 
1531 aa  382  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  38.27 
 
 
645 aa  383  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  31.04 
 
 
1568 aa  384  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  30.2 
 
 
1348 aa  382  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  41.17 
 
 
862 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>