More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3019 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  47.92 
 
 		 874 aa  656    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  47.92 
 
 		 916 aa  656    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  91.73 
 
 		 1057 aa  1346    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 1048 aa  2035    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  85.57 
 
 		 858 aa  1270    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  47.92 
 
 		 922 aa  656    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  85.57 
 
 		 930 aa  1270    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  85.57 
 
 		 896 aa  1270    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  85.15 
 
 		 872 aa  1271    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  43.21 
 
 		 724 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  44.72 
 
 		 729 aa  559  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  44.56 
 
 		 729 aa  556  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  44.46 
 
 		 676 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  45.6 
 
 		 714 aa  548  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  44.17 
 
 		 730 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  45.7 
 
 		 725 aa  544  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  45.09 
 
 		 743 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  49.82 
 
 		 775 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  49.82 
 
 		 775 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  49.82 
 
 		 775 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  49.82 
 
 		 775 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  49.82 
 
 		 775 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  49.82 
 
 		 775 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  49.82 
 
 		 775 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  46.09 
 
 		 1981 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  47.77 
 
 		 540 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  42.2 
 
 		 845 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  44.34 
 
 		 822 aa  469  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  39.25 
 
 		 794 aa  469  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  44.16 
 
 		 1048 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  43.52 
 
 		 843 aa  459  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  41.69 
 
 		 845 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  45.3 
 
 		 826 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  44.24 
 
 		 862 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  44.17 
 
 		 862 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  43.54 
 
 		 1284 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  38.2 
 
 		 734 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  38.2 
 
 		 734 aa  399  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  38.2 
 
 		 731 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  38.2 
 
 		 734 aa  399  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  38.2 
 
 		 731 aa  399  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  38.2 
 
 		 734 aa  399  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  36.44 
 
 		 646 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  38.2 
 
 		 734 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  38.2 
 
 		 734 aa  399  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  37.08 
 
 		 643 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  40.33 
 
 		 796 aa  393  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  37.43 
 
 		 777 aa  389  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  33.59 
 
 		 748 aa  386  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  36.83 
 
 		 780 aa  382  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  37.62 
 
 		 757 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  37.73 
 
 		 734 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  33.46 
 
 		 774 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  35.84 
 
 		 645 aa  379  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  34.83 
 
 		 788 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  37.4 
 
 		 734 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  39.39 
 
 		 907 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  36.01 
 
 		 778 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  39.52 
 
 		 1284 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  34.8 
 
 		 712 aa  365  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  38.03 
 
 		 792 aa  365  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  33.88 
 
 		 756 aa  365  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 741 aa  365  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  38.86 
 
 		 572 aa  364  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  33.56 
 
 		 755 aa  364  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  35.25 
 
 		 794 aa  362  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  33.87 
 
 		 730 aa  362  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  35.57 
 
 		 683 aa  361  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  34.73 
 
 		 689 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  34.98 
 
 		 683 aa  358  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  35.14 
 
 		 689 aa  356  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  39.59 
 
 		 901 aa  356  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  32.06 
 
 		 741 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  31.95 
 
 		 741 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  38.93 
 
 		 841 aa  350  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  38.93 
 
 		 841 aa  350  7e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  39.05 
 
 		 838 aa  350  7e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  33.73 
 
 		 771 aa  350  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  38.46 
 
 		 886 aa  348  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 		 785 aa  347  6e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  37.78 
 
 		 975 aa  343  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  38.17 
 
 		 841 aa  342  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  36.45 
 
 		 889 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  35.47 
 
 		 735 aa  337  5e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  34.14 
 
 		 769 aa  336  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  35.96 
 
 		 767 aa  333  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  35.96 
 
 		 767 aa  333  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  33.74 
 
 		 687 aa  332  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  36.13 
 
 		 837 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  35.75 
 
 		 920 aa  327  9e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  35.94 
 
 		 885 aa  324  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  35.94 
 
 		 918 aa  323  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  35.42 
 
 		 618 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  32.5 
 
 		 703 aa  316  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  35.89 
 
 		 783 aa  315  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  32.93 
 
 		 661 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  34.99 
 
 		 840 aa  313  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  33.39 
 
 		 846 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  31.02 
 
 		 754 aa  310  6.999999999999999e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  32.63 
 
 		 661 aa  308  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>