More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5469 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  43.48 
 
 
941 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 
1284 aa  2642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  43.04 
 
 
918 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  43.61 
 
 
920 aa  662    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  48.01 
 
 
843 aa  772    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  50.36 
 
 
845 aa  830    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  42.35 
 
 
885 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  50.36 
 
 
845 aa  825    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  81.93 
 
 
1284 aa  2165    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  45.17 
 
 
837 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  41.91 
 
 
846 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  41.93 
 
 
840 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  40.82 
 
 
952 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  40.63 
 
 
924 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  40.16 
 
 
889 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  38.89 
 
 
822 aa  536  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  38.94 
 
 
826 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  36.41 
 
 
912 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  37.52 
 
 
886 aa  466  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  34.46 
 
 
1048 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  36.98 
 
 
975 aa  452  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  35.58 
 
 
901 aa  446  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  34.63 
 
 
862 aa  429  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  34.29 
 
 
862 aa  423  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  42.51 
 
 
676 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  42.32 
 
 
725 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  40.49 
 
 
1057 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  38.59 
 
 
1048 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  40.04 
 
 
775 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  40 
 
 
858 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  40 
 
 
896 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  40 
 
 
930 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  39.81 
 
 
872 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  39.86 
 
 
775 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  40.14 
 
 
775 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  39.1 
 
 
729 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  39.1 
 
 
729 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  40.14 
 
 
775 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  39.86 
 
 
775 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  40.14 
 
 
775 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  40.14 
 
 
775 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  40.67 
 
 
743 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  38.01 
 
 
916 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  38.01 
 
 
922 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  38.01 
 
 
874 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  40.12 
 
 
724 aa  366  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  38.38 
 
 
730 aa  365  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  38.93 
 
 
714 aa  358  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  39.21 
 
 
540 aa  347  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  31.84 
 
 
968 aa  341  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  31.77 
 
 
855 aa  337  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  39.26 
 
 
1981 aa  337  9e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  37.11 
 
 
794 aa  335  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  32.53 
 
 
869 aa  330  8e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  32.34 
 
 
871 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  32.24 
 
 
875 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  28.95 
 
 
838 aa  312  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  28.64 
 
 
910 aa  301  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  28.7 
 
 
958 aa  293  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  33.57 
 
 
841 aa  289  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  33.57 
 
 
841 aa  289  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  33.27 
 
 
841 aa  288  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  29.01 
 
 
1074 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  30 
 
 
890 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  35.38 
 
 
788 aa  282  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  36.01 
 
 
778 aa  281  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  29.24 
 
 
1019 aa  280  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  35.92 
 
 
774 aa  280  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  27.09 
 
 
853 aa  279  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  35.17 
 
 
756 aa  279  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  28.54 
 
 
1019 aa  279  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  28.05 
 
 
853 aa  279  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  35.17 
 
 
907 aa  278  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  36.31 
 
 
780 aa  278  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  35.17 
 
 
748 aa  278  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  35.17 
 
 
755 aa  278  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  27.88 
 
 
895 aa  278  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  28.81 
 
 
1063 aa  278  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  28.81 
 
 
1063 aa  278  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  28.4 
 
 
895 aa  277  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  35.17 
 
 
572 aa  277  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  38.3 
 
 
757 aa  277  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  28.55 
 
 
1057 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  36.71 
 
 
734 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  28.93 
 
 
1063 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  37.3 
 
 
734 aa  276  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  37.3 
 
 
731 aa  275  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  28.27 
 
 
892 aa  275  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  37.3 
 
 
731 aa  275  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  37.3 
 
 
734 aa  276  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  37.3 
 
 
734 aa  276  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  37.3 
 
 
734 aa  276  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  37.3 
 
 
734 aa  276  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  28.19 
 
 
895 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  27.56 
 
 
923 aa  272  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  35.95 
 
 
734 aa  273  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  31.71 
 
 
834 aa  273  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  27.7 
 
 
895 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  35.53 
 
 
785 aa  272  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  31.71 
 
 
834 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.611211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>