More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0201 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  55.82 
 
 		 796 aa  772    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  47.21 
 
 		 780 aa  699    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 777 aa  1596    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  53.44 
 
 		 687 aa  578  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  43.1 
 
 		 734 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  43.1 
 
 		 734 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  43.1 
 
 		 734 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  43.33 
 
 		 731 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  43.1 
 
 		 734 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  43.1 
 
 		 734 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  42.96 
 
 		 734 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  46.7 
 
 		 731 aa  561  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  44.96 
 
 		 734 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  44.96 
 
 		 734 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  44.73 
 
 		 755 aa  555  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  44.62 
 
 		 756 aa  549  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  43.85 
 
 		 774 aa  549  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  45.12 
 
 		 907 aa  546  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  45.48 
 
 		 778 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  45.33 
 
 		 794 aa  545  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  44.72 
 
 		 788 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  44.81 
 
 		 757 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  44.48 
 
 		 748 aa  538  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  44.64 
 
 		 730 aa  531  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  43.43 
 
 		 792 aa  525  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  47.6 
 
 		 572 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  41.11 
 
 		 769 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  49.61 
 
 		 841 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  48.82 
 
 		 841 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  48.82 
 
 		 841 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  48.43 
 
 		 838 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  41.01 
 
 		 645 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  39.66 
 
 		 712 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  42.84 
 
 		 785 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  39.77 
 
 		 741 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  39.03 
 
 		 741 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  38.25 
 
 		 741 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  40.06 
 
 		 689 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  39.91 
 
 		 689 aa  482  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  40.16 
 
 		 735 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  48.2 
 
 		 886 aa  468  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  47.35 
 
 		 901 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  39.84 
 
 		 646 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  39.75 
 
 		 643 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  39.6 
 
 		 753 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  36.24 
 
 		 771 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  45.47 
 
 		 975 aa  452  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  38.25 
 
 		 794 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  34.77 
 
 		 724 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  41.06 
 
 		 775 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  41.06 
 
 		 775 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  41.06 
 
 		 775 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  39.04 
 
 		 725 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  40.88 
 
 		 775 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  40.88 
 
 		 775 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  40.88 
 
 		 775 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  40.88 
 
 		 775 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  36.85 
 
 		 714 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  38.74 
 
 		 676 aa  435  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  38.69 
 
 		 743 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  37.33 
 
 		 872 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  39.34 
 
 		 729 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  39.16 
 
 		 730 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  39.51 
 
 		 729 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  37.18 
 
 		 858 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  37.18 
 
 		 896 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  37.18 
 
 		 930 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  37.2 
 
 		 661 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  37.52 
 
 		 1057 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  36.95 
 
 		 874 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  37.04 
 
 		 661 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  37.04 
 
 		 661 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  37.04 
 
 		 661 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  37.18 
 
 		 1048 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  37.36 
 
 		 661 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  36.95 
 
 		 916 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  37.41 
 
 		 767 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  37.2 
 
 		 661 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  36.95 
 
 		 922 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  37.04 
 
 		 661 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  37.04 
 
 		 661 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  35.88 
 
 		 703 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  33.42 
 
 		 1981 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  37.1 
 
 		 767 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  35.11 
 
 		 619 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  34.1 
 
 		 683 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  37.61 
 
 		 683 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  35.52 
 
 		 783 aa  392  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  39.15 
 
 		 618 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  34.84 
 
 		 792 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  36.94 
 
 		 613 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  38.12 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  37.67 
 
 		 614 aa  366  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  37.88 
 
 		 540 aa  362  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  33.64 
 
 		 641 aa  357  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  36.66 
 
 		 616 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  34.41 
 
 		 668 aa  346  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  33.69 
 
 		 669 aa  343  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  33.63 
 
 		 668 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  33.28 
 
 		 642 aa  340  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>