More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_33960 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  79.82 
 
 		 669 aa  1102    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  86.23 
 
 		 668 aa  1208    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  100 
 
 		 668 aa  1371    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  81.89 
 
 		 668 aa  1134    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  40.49 
 
 		 641 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  40.03 
 
 		 683 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  39.09 
 
 		 683 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  39.06 
 
 		 642 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  36.35 
 
 		 741 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  36.21 
 
 		 741 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  36.84 
 
 		 741 aa  405  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  34.66 
 
 		 709 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  35.01 
 
 		 907 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  35.93 
 
 		 619 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  37.86 
 
 		 783 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  35.76 
 
 		 771 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  35.99 
 
 		 755 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  36.36 
 
 		 748 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  36.75 
 
 		 689 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  36.26 
 
 		 689 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  35.15 
 
 		 754 aa  372  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  36.8 
 
 		 774 aa  372  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  36.14 
 
 		 643 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  36.14 
 
 		 646 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  36.23 
 
 		 788 aa  369  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  35.44 
 
 		 756 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  33.03 
 
 		 692 aa  363  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  34.35 
 
 		 714 aa  362  9e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  34.45 
 
 		 680 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  35.84 
 
 		 778 aa  362  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  35.57 
 
 		 785 aa  360  6e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  33.85 
 
 		 754 aa  360  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  37.02 
 
 		 656 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  35.69 
 
 		 794 aa  358  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  35.02 
 
 		 693 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  36.84 
 
 		 655 aa  356  7.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  35.89 
 
 		 734 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  35.89 
 
 		 734 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  35.89 
 
 		 734 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  35.89 
 
 		 734 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  35.89 
 
 		 734 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  35.89 
 
 		 734 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  36.9 
 
 		 780 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  35.89 
 
 		 731 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  34.95 
 
 		 771 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  35.34 
 
 		 731 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  35.77 
 
 		 767 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  36.7 
 
 		 694 aa  350  6e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  33.69 
 
 		 741 aa  350  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  36.89 
 
 		 767 aa  350  7e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  39.16 
 
 		 572 aa  349  8e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  33.9 
 
 		 692 aa  349  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  35.41 
 
 		 702 aa  349  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  34.71 
 
 		 792 aa  349  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  33.69 
 
 		 741 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  34.51 
 
 		 730 aa  349  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  37.68 
 
 		 616 aa  347  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  37.25 
 
 		 615 aa  347  4e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  34.29 
 
 		 794 aa  347  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  38.59 
 
 		 617 aa  347  6e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  36.87 
 
 		 741 aa  346  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  35.86 
 
 		 697 aa  346  8.999999999999999e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  35.59 
 
 		 678 aa  346  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  39.17 
 
 		 609 aa  345  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  34.47 
 
 		 680 aa  345  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  32.95 
 
 		 724 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  37.5 
 
 		 734 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  36.48 
 
 		 617 aa  342  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  35.5 
 
 		 618 aa  342  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  36.48 
 
 		 617 aa  342  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  35.92 
 
 		 808 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  36.01 
 
 		 680 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  36.53 
 
 		 617 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  34.99 
 
 		 703 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  35.05 
 
 		 729 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  35.05 
 
 		 729 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  33.84 
 
 		 777 aa  340  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  35.74 
 
 		 688 aa  340  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  33.76 
 
 		 678 aa  339  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  37.14 
 
 		 734 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  36.65 
 
 		 757 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  34.7 
 
 		 796 aa  339  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  37.02 
 
 		 619 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  35.82 
 
 		 680 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  36.38 
 
 		 790 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  34.58 
 
 		 730 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  35.83 
 
 		 610 aa  333  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  35.46 
 
 		 732 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  33.5 
 
 		 678 aa  331  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  36.6 
 
 		 743 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  35.87 
 
 		 763 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  35.14 
 
 		 684 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  35.08 
 
 		 618 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  34.35 
 
 		 858 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  35.42 
 
 		 725 aa  327  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  34.35 
 
 		 872 aa  328  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  34.35 
 
 		 930 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  34.35 
 
 		 896 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  35.14 
 
 		 699 aa  325  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  33.18 
 
 		 618 aa  324  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>