More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01965 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  63.11 
 
 
754 aa  933    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  100 
 
 
771 aa  1607    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  64.75 
 
 
692 aa  941    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  64.45 
 
 
692 aa  959    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  61.38 
 
 
754 aa  917    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  34.38 
 
 
682 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  32.36 
 
 
741 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  32.36 
 
 
741 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  35.5 
 
 
656 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  37.93 
 
 
616 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  34.88 
 
 
617 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  35.32 
 
 
609 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  32.91 
 
 
706 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  32.33 
 
 
741 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  38.43 
 
 
615 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  34.57 
 
 
617 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  34.88 
 
 
617 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  32.7 
 
 
741 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  34.64 
 
 
619 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  32.41 
 
 
741 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  34.34 
 
 
683 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  34.14 
 
 
678 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  35.6 
 
 
655 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  33.53 
 
 
678 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  35.1 
 
 
617 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  33.86 
 
 
618 aa  369  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  36.31 
 
 
740 aa  369  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  38.61 
 
 
610 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  35.96 
 
 
740 aa  365  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  31.54 
 
 
709 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  33.92 
 
 
683 aa  361  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  33.94 
 
 
693 aa  361  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  33.71 
 
 
684 aa  360  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 
678 aa  359  9e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  34.98 
 
 
741 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  34.35 
 
 
723 aa  356  8.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  33.18 
 
 
680 aa  356  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  33.28 
 
 
689 aa  356  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  31.98 
 
 
697 aa  355  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  34.95 
 
 
668 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  33.58 
 
 
763 aa  354  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  31.24 
 
 
706 aa  354  4e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  31.81 
 
 
726 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  30.45 
 
 
771 aa  352  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  31.64 
 
 
1017 aa  352  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  34.78 
 
 
694 aa  352  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  32.15 
 
 
702 aa  352  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  31.29 
 
 
725 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  36.01 
 
 
706 aa  351  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  32.87 
 
 
680 aa  351  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  32.39 
 
 
727 aa  350  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  33.98 
 
 
699 aa  350  5e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  31.41 
 
 
725 aa  350  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  32.86 
 
 
732 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  33.65 
 
 
689 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  31 
 
 
725 aa  348  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  33.79 
 
 
655 aa  346  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  33.86 
 
 
680 aa  344  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  31.8 
 
 
722 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  33.43 
 
 
680 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  34.09 
 
 
687 aa  342  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  33.55 
 
 
694 aa  342  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  34.09 
 
 
687 aa  342  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  34.09 
 
 
687 aa  342  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  30.69 
 
 
774 aa  342  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  31.56 
 
 
697 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  31.89 
 
 
671 aa  340  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2858  type VI secretion system Vgr family protein  32.07 
 
 
692 aa  340  8e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374803  normal  0.207801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  33.65 
 
 
668 aa  339  9e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  35 
 
 
1095 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4049  vgrG protein  30.18 
 
 
771 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253476  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  33.39 
 
 
646 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3949  Rhs element Vgr protein  32.83 
 
 
691 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  31.16 
 
 
724 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  31 
 
 
722 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  32.04 
 
 
688 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  32.7 
 
 
669 aa  337  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  32.91 
 
 
643 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  31.41 
 
 
703 aa  336  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  33.07 
 
 
748 aa  334  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3482  Rhs element Vgr protein  33.44 
 
 
675 aa  334  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192027  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  33.18 
 
 
756 aa  333  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  32.52 
 
 
680 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  33.13 
 
 
794 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  33.28 
 
 
778 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  32.04 
 
 
808 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  31.18 
 
 
722 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  32.2 
 
 
788 aa  332  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  32.53 
 
 
668 aa  331  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  33.9 
 
 
907 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  33.18 
 
 
755 aa  330  6e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  30.54 
 
 
704 aa  330  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  35.94 
 
 
968 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  30.18 
 
 
730 aa  327  7e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  32.12 
 
 
694 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  29.05 
 
 
713 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  30.2 
 
 
712 aa  324  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  33.55 
 
 
675 aa  324  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  32.23 
 
 
618 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  35.56 
 
 
790 aa  320  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>