More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000448 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  67.1 
 
 
754 aa  983    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  63.92 
 
 
754 aa  940    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  100 
 
 
692 aa  1439    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  64.16 
 
 
771 aa  954    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  94.51 
 
 
692 aa  1377    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  34.76 
 
 
741 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  34.62 
 
 
741 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  33.7 
 
 
741 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  38.29 
 
 
616 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  33.74 
 
 
741 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  38.25 
 
 
615 aa  411  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  36.39 
 
 
609 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  34.32 
 
 
619 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  34.61 
 
 
682 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  35.53 
 
 
617 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  34.5 
 
 
678 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  35.53 
 
 
617 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  33.33 
 
 
709 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  35.03 
 
 
617 aa  405  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  33.82 
 
 
706 aa  405  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  37.37 
 
 
656 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  33.52 
 
 
741 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  34.59 
 
 
678 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  34.39 
 
 
740 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  35.15 
 
 
683 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  34.24 
 
 
740 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  35.32 
 
 
655 aa  395  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  35.56 
 
 
693 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  37.37 
 
 
618 aa  392  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  33.43 
 
 
702 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  38.91 
 
 
610 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  34.2 
 
 
697 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  37.15 
 
 
617 aa  389  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  33.63 
 
 
684 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  35.55 
 
 
683 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  32.95 
 
 
725 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  32.95 
 
 
725 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  32.18 
 
 
722 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  32.67 
 
 
726 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  34.52 
 
 
763 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  36.29 
 
 
678 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2858  type VI secretion system Vgr family protein  32.68 
 
 
692 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374803  normal  0.207801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  34.03 
 
 
756 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  34.66 
 
 
680 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  33.09 
 
 
722 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  38.07 
 
 
732 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  36.07 
 
 
741 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  33.89 
 
 
755 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  36.83 
 
 
694 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  32.73 
 
 
689 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  34.34 
 
 
680 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  35.4 
 
 
694 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  34.8 
 
 
680 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  34.82 
 
 
688 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  31.99 
 
 
689 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4049  vgrG protein  33.24 
 
 
771 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253476  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  32.35 
 
 
748 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  32.36 
 
 
694 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  32.07 
 
 
1017 aa  369  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  34.05 
 
 
774 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  32.78 
 
 
730 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  35.62 
 
 
655 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  34.8 
 
 
697 aa  368  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  34.9 
 
 
699 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  34.66 
 
 
808 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  36.56 
 
 
1095 aa  365  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  35.28 
 
 
727 aa  365  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  32.15 
 
 
722 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  30.94 
 
 
724 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  34.25 
 
 
907 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  34.9 
 
 
788 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  36.07 
 
 
706 aa  362  9e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  34.07 
 
 
703 aa  362  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  34.85 
 
 
706 aa  362  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  30.52 
 
 
771 aa  362  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  32.9 
 
 
713 aa  362  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  32.19 
 
 
680 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  32.9 
 
 
704 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  36.24 
 
 
687 aa  360  7e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  36.24 
 
 
687 aa  360  7e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  36.24 
 
 
687 aa  360  7e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  32.29 
 
 
712 aa  359  9e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  35.74 
 
 
723 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  35.05 
 
 
725 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  30.47 
 
 
767 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  37.33 
 
 
968 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  36.07 
 
 
618 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  32.42 
 
 
668 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3949  Rhs element Vgr protein  33.53 
 
 
691 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  32.02 
 
 
734 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  30.13 
 
 
767 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  30.37 
 
 
734 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  33.99 
 
 
783 aa  350  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  30.37 
 
 
734 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  30.37 
 
 
734 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  33.23 
 
 
778 aa  349  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  30.37 
 
 
734 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  30.37 
 
 
734 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  30.37 
 
 
734 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  30.37 
 
 
731 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>