More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0410 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  80.79 
 
 
734 aa  1268    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
734 aa  1530    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
734 aa  1530    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  80.38 
 
 
734 aa  1261    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  99.86 
 
 
731 aa  1523    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  79.3 
 
 
757 aa  1076    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  97.4 
 
 
731 aa  1486    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  99.86 
 
 
734 aa  1527    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
734 aa  1530    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
734 aa  1530    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
734 aa  1530    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  44.26 
 
 
748 aa  633  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  43.34 
 
 
774 aa  630  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  42.62 
 
 
907 aa  625  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  43.27 
 
 
755 aa  617  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  43.4 
 
 
756 aa  615  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  42.91 
 
 
788 aa  608  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  44.28 
 
 
778 aa  610  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  43.65 
 
 
730 aa  608  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  44.28 
 
 
794 aa  606  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  42.04 
 
 
792 aa  600  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  42.71 
 
 
785 aa  596  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  42.64 
 
 
741 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  44.16 
 
 
741 aa  592  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  42.37 
 
 
741 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  46.33 
 
 
780 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  42.9 
 
 
712 aa  569  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  46.43 
 
 
777 aa  564  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  48.32 
 
 
572 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  40.9 
 
 
796 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  40.05 
 
 
767 aa  548  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  39.66 
 
 
767 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  42.2 
 
 
689 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  42.06 
 
 
689 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  50.1 
 
 
841 aa  525  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  50.1 
 
 
841 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  50.1 
 
 
841 aa  525  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  50.3 
 
 
838 aa  525  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  45.86 
 
 
687 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  45.48 
 
 
643 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  45.15 
 
 
646 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  39.68 
 
 
794 aa  507  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  38.47 
 
 
771 aa  497  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  48.18 
 
 
901 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  38.34 
 
 
724 aa  492  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  47.8 
 
 
886 aa  489  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  45.44 
 
 
645 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  46.27 
 
 
975 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  38 
 
 
783 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  39.12 
 
 
769 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  39.93 
 
 
714 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  36.55 
 
 
792 aa  468  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  41.32 
 
 
725 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  37.08 
 
 
735 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  39.46 
 
 
676 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  39.14 
 
 
743 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  38.28 
 
 
729 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  38.45 
 
 
729 aa  446  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  37.69 
 
 
730 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  36.72 
 
 
753 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  37.87 
 
 
872 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  40.3 
 
 
1981 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  41.5 
 
 
775 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  41.5 
 
 
775 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  41.71 
 
 
775 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  41.71 
 
 
775 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  41.5 
 
 
775 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  41.5 
 
 
775 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  41.5 
 
 
775 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  38.35 
 
 
874 aa  429  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  38.35 
 
 
916 aa  429  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  38.35 
 
 
922 aa  429  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  39.42 
 
 
683 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  37.57 
 
 
858 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  37.57 
 
 
896 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  37.57 
 
 
930 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  38.52 
 
 
1057 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  36.2 
 
 
703 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  38.13 
 
 
1048 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  38.47 
 
 
683 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  39.08 
 
 
619 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  32.96 
 
 
741 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  32.96 
 
 
741 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  35.85 
 
 
661 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  37.23 
 
 
645 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 
661 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 
661 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 
661 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  35.34 
 
 
661 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 
661 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 
661 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 
661 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  35.54 
 
 
1003 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  38.64 
 
 
618 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  33.98 
 
 
669 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  31.87 
 
 
709 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  42.7 
 
 
540 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  32.68 
 
 
704 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  37.78 
 
 
613 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  36.39 
 
 
668 aa  363  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>