More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2332 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  72.93 
 
 		 646 aa  895    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  71.21 
 
 		 689 aa  984    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  79.49 
 
 		 741 aa  1244    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  45.17 
 
 		 771 aa  655    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  73.45 
 
 		 643 aa  891    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  79.35 
 
 		 741 aa  1237    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  70.34 
 
 		 689 aa  986    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 741 aa  1536    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  44.03 
 
 		 748 aa  619  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  42.6 
 
 		 907 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  43.29 
 
 		 774 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  45.44 
 
 		 730 aa  605  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  42.8 
 
 		 792 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  43.59 
 
 		 755 aa  592  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  43.59 
 
 		 756 aa  595  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  44.16 
 
 		 734 aa  592  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  44.16 
 
 		 731 aa  592  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  44.02 
 
 		 731 aa  588  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  44.02 
 
 		 734 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  40.72 
 
 		 788 aa  589  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  44.16 
 
 		 734 aa  592  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  44.16 
 
 		 734 aa  592  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  44.16 
 
 		 734 aa  592  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  44.16 
 
 		 734 aa  592  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  44.05 
 
 		 778 aa  578  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  40.13 
 
 		 767 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  43.9 
 
 		 794 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  40.26 
 
 		 767 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  40.43 
 
 		 792 aa  569  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  41.44 
 
 		 785 aa  558  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  40.41 
 
 		 734 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  40.14 
 
 		 734 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  39.65 
 
 		 757 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  39.78 
 
 		 712 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  39.72 
 
 		 783 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  39.27 
 
 		 796 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  38.96 
 
 		 703 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  38.47 
 
 		 724 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  45.72 
 
 		 572 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  39.5 
 
 		 683 aa  497  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  39.85 
 
 		 683 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  40.08 
 
 		 794 aa  492  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  40.31 
 
 		 777 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  39.84 
 
 		 645 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  40.75 
 
 		 780 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  41.17 
 
 		 619 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  45.94 
 
 		 838 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  38.13 
 
 		 725 aa  445  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  45.94 
 
 		 841 aa  445  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  45.94 
 
 		 841 aa  445  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  42.56 
 
 		 687 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  34.18 
 
 		 1981 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  45.15 
 
 		 841 aa  439  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  39.1 
 
 		 714 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  34.03 
 
 		 709 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  38.41 
 
 		 645 aa  435  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  36.06 
 
 		 769 aa  419  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  37.1 
 
 		 735 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  37.73 
 
 		 669 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  38.58 
 
 		 661 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  38.58 
 
 		 661 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  38.58 
 
 		 661 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  38.92 
 
 		 661 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  38.58 
 
 		 661 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  38.75 
 
 		 661 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  33.9 
 
 		 754 aa  412  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  38.92 
 
 		 661 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  39.05 
 
 		 730 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  39.12 
 
 		 729 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  33.38 
 
 		 692 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  38.41 
 
 		 661 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  37.3 
 
 		 676 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  39.02 
 
 		 743 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  38.06 
 
 		 668 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  38.77 
 
 		 729 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  36.84 
 
 		 668 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  33.61 
 
 		 741 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  43.03 
 
 		 975 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  33.61 
 
 		 741 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  33.61 
 
 		 692 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  42.55 
 
 		 886 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  37.27 
 
 		 668 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  36.29 
 
 		 753 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  42.15 
 
 		 901 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  38.46 
 
 		 641 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  31.92 
 
 		 754 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  38.26 
 
 		 775 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  32.01 
 
 		 706 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  38.26 
 
 		 775 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  34.84 
 
 		 872 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  38.26 
 
 		 775 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  35.42 
 
 		 1057 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  32.41 
 
 		 771 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  38.08 
 
 		 775 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  34.99 
 
 		 858 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  38.08 
 
 		 775 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  38.08 
 
 		 775 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  34.99 
 
 		 930 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  34.99 
 
 		 896 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  38.08 
 
 		 775 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>