More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2047 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  71.71 
 
 
841 aa  799    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  77.1 
 
 
778 aa  951    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  72.6 
 
 
730 aa  885    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  96.15 
 
 
788 aa  1163    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  75 
 
 
792 aa  935    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  99.3 
 
 
756 aa  1195    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  70.93 
 
 
838 aa  794    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  77.1 
 
 
794 aa  949    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  97.38 
 
 
907 aa  1174    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  95.63 
 
 
748 aa  1152    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  95.28 
 
 
774 aa  1151    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  70.75 
 
 
785 aa  853    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  71.32 
 
 
841 aa  793    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  98.08 
 
 
755 aa  1176    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  71.71 
 
 
841 aa  799    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
572 aa  1191    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  58.16 
 
 
886 aa  605  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  54.62 
 
 
901 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  55.38 
 
 
975 aa  594  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  48.32 
 
 
734 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  48.32 
 
 
734 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  48.32 
 
 
734 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  48.32 
 
 
734 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  48.32 
 
 
734 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  48.32 
 
 
734 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  48.22 
 
 
731 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  47.62 
 
 
757 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  48.04 
 
 
731 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  46.6 
 
 
734 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  46.26 
 
 
734 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  46.96 
 
 
780 aa  528  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  47.6 
 
 
777 aa  518  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  46.07 
 
 
741 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  47.9 
 
 
687 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  46.49 
 
 
796 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  46.25 
 
 
689 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  45.72 
 
 
741 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  45.72 
 
 
741 aa  501  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  45.72 
 
 
689 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  45.83 
 
 
794 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  43.51 
 
 
724 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  44.54 
 
 
645 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  44.19 
 
 
712 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  44.69 
 
 
771 aa  482  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  44.13 
 
 
743 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  43.46 
 
 
729 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  42.78 
 
 
730 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  43.46 
 
 
729 aa  472  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  42.51 
 
 
646 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  41.99 
 
 
643 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  41.79 
 
 
725 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  41.7 
 
 
769 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  41.84 
 
 
683 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  41.14 
 
 
714 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  40.97 
 
 
683 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  41.74 
 
 
735 aa  437  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  41.29 
 
 
676 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  42.88 
 
 
753 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  40.11 
 
 
1981 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  39.44 
 
 
775 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  39.51 
 
 
775 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  39.51 
 
 
775 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  39.51 
 
 
775 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  39.44 
 
 
775 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  40.11 
 
 
767 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  39.51 
 
 
775 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  39.44 
 
 
775 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  39.93 
 
 
767 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  40.4 
 
 
703 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  40.83 
 
 
618 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  39.33 
 
 
661 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  38.82 
 
 
661 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  39.79 
 
 
783 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  38.82 
 
 
661 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  39.26 
 
 
661 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  38.99 
 
 
661 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  38.82 
 
 
661 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  38.82 
 
 
661 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  38.82 
 
 
661 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  38.85 
 
 
618 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  38.84 
 
 
614 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  37.19 
 
 
792 aa  382  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  38.92 
 
 
540 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  36.84 
 
 
916 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  36.84 
 
 
922 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  36.84 
 
 
874 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  39.34 
 
 
616 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  37.54 
 
 
613 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  37.59 
 
 
872 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  38 
 
 
1057 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  37.93 
 
 
1048 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  37.59 
 
 
930 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  37.59 
 
 
858 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  37.59 
 
 
896 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  37.11 
 
 
645 aa  364  3e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  36.1 
 
 
641 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  36.71 
 
 
619 aa  355  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  39.16 
 
 
668 aa  349  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  37.96 
 
 
680 aa  349  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  37.07 
 
 
702 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>