More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0322 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  92.88 
 
 
729 aa  1363    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  92.74 
 
 
729 aa  1387    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  100 
 
 
730 aa  1521    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  79.05 
 
 
743 aa  1123    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  43.81 
 
 
1057 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  43.5 
 
 
1048 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  42.79 
 
 
930 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  42.79 
 
 
896 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  42.79 
 
 
858 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  42.64 
 
 
872 aa  538  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  43.79 
 
 
676 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  46.08 
 
 
794 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  44.22 
 
 
714 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  42.26 
 
 
724 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  43.76 
 
 
725 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  41.94 
 
 
1981 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  46.06 
 
 
775 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  46.06 
 
 
775 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  46.06 
 
 
775 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  46.06 
 
 
775 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  45.87 
 
 
775 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  46.06 
 
 
775 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  46.06 
 
 
775 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  41.33 
 
 
874 aa  485  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  41.33 
 
 
922 aa  485  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  41.33 
 
 
916 aa  485  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  43.36 
 
 
907 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  41.93 
 
 
748 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  42.78 
 
 
572 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  41.81 
 
 
774 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  42.73 
 
 
756 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  41.1 
 
 
788 aa  465  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  42.83 
 
 
755 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  41.65 
 
 
778 aa  462  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  43.18 
 
 
730 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  41.48 
 
 
794 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  41.65 
 
 
792 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  38.56 
 
 
734 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  41.47 
 
 
757 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  41.2 
 
 
796 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  38.24 
 
 
734 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  45.19 
 
 
540 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  38.02 
 
 
731 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  37.69 
 
 
734 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  37.69 
 
 
734 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  37.69 
 
 
731 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  37.69 
 
 
734 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  37.69 
 
 
734 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  37.69 
 
 
734 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  37.69 
 
 
734 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  39.22 
 
 
785 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  42.41 
 
 
841 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  39.89 
 
 
771 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  42.8 
 
 
841 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  39.16 
 
 
777 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  42.97 
 
 
838 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  42.8 
 
 
841 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  38.03 
 
 
646 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  36.83 
 
 
645 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  38.13 
 
 
643 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  38.96 
 
 
741 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  42.31 
 
 
826 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  39.7 
 
 
1048 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  39.05 
 
 
741 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  38.96 
 
 
741 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  43.51 
 
 
862 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  39.44 
 
 
689 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  38.97 
 
 
780 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  43.51 
 
 
862 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  39.61 
 
 
689 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  37.37 
 
 
712 aa  395  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  41.22 
 
 
975 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  41.42 
 
 
901 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  39.67 
 
 
767 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  39.96 
 
 
843 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  41.29 
 
 
886 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  39.02 
 
 
845 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  39.02 
 
 
767 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  38.14 
 
 
687 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  39.51 
 
 
822 aa  382  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  39.42 
 
 
845 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  35.35 
 
 
618 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  35.49 
 
 
613 aa  376  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  38.46 
 
 
1284 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  35.92 
 
 
735 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  34.78 
 
 
683 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  34.24 
 
 
683 aa  364  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  33.44 
 
 
618 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  35.39 
 
 
769 aa  357  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  38.38 
 
 
1284 aa  352  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  37.94 
 
 
783 aa  347  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  32.51 
 
 
703 aa  347  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  36.15 
 
 
669 aa  340  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  35.18 
 
 
753 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  31.79 
 
 
732 aa  336  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  34.19 
 
 
661 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  34.19 
 
 
661 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  34.19 
 
 
661 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  34.19 
 
 
661 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  34.58 
 
 
668 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>