More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3914 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  43.21 
 
 
840 aa  691    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  43.78 
 
 
952 aa  651    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  52.25 
 
 
846 aa  863    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  43.41 
 
 
885 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  74.02 
 
 
843 aa  1299    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  42.87 
 
 
822 aa  645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  45.15 
 
 
826 aa  687    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  50.36 
 
 
1284 aa  815    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  42.86 
 
 
918 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  87.68 
 
 
845 aa  1547    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  52.09 
 
 
1284 aa  845    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  45.25 
 
 
941 aa  714    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  42.76 
 
 
837 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 
845 aa  1743    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  42.89 
 
 
920 aa  695    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  43.53 
 
 
889 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  42.82 
 
 
924 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  41.69 
 
 
912 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  40.7 
 
 
975 aa  552  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  42.66 
 
 
886 aa  539  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  39.53 
 
 
901 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  36.37 
 
 
1048 aa  512  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  37.41 
 
 
862 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  37.16 
 
 
862 aa  482  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  43.65 
 
 
1057 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  46.72 
 
 
725 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  46.53 
 
 
676 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  41.85 
 
 
1048 aa  452  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  42.7 
 
 
872 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  42.7 
 
 
858 aa  446  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  42.7 
 
 
896 aa  446  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  42.7 
 
 
930 aa  446  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  44.6 
 
 
775 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  44.78 
 
 
775 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  44.78 
 
 
775 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  44.6 
 
 
775 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  44.6 
 
 
775 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  44.6 
 
 
775 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  42.34 
 
 
714 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  44.6 
 
 
775 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  33.6 
 
 
855 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  33.7 
 
 
968 aa  412  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  41.65 
 
 
724 aa  412  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  39.07 
 
 
916 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  39.07 
 
 
922 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  40.58 
 
 
743 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  39.07 
 
 
874 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  42.86 
 
 
540 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  40.14 
 
 
729 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  43.27 
 
 
1981 aa  396  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  39.96 
 
 
729 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  38.95 
 
 
730 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  39.32 
 
 
794 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  32.08 
 
 
910 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  34.86 
 
 
890 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  33.25 
 
 
834 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  33.25 
 
 
834 aa  349  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  33.25 
 
 
834 aa  348  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  33.24 
 
 
865 aa  346  8.999999999999999e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  34.36 
 
 
907 aa  340  7e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  33.83 
 
 
885 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  30.06 
 
 
841 aa  334  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  30.06 
 
 
841 aa  334  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  30.26 
 
 
841 aa  332  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  29.71 
 
 
838 aa  330  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  36.67 
 
 
780 aa  319  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  36.36 
 
 
796 aa  318  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  36.33 
 
 
731 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  36.33 
 
 
734 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  36.33 
 
 
734 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  36.33 
 
 
734 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  36.33 
 
 
734 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  36.33 
 
 
734 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  36.33 
 
 
731 aa  314  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  36.12 
 
 
734 aa  313  9e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  28.35 
 
 
1057 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  28.82 
 
 
1063 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  28.82 
 
 
1063 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  28.18 
 
 
1059 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  27.89 
 
 
1074 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  28.47 
 
 
1063 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  28.77 
 
 
852 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  27.77 
 
 
1057 aa  303  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  36.85 
 
 
757 aa  301  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  36.2 
 
 
778 aa  300  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  34.4 
 
 
777 aa  300  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  35.65 
 
 
774 aa  300  9e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  36.66 
 
 
734 aa  300  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  28.41 
 
 
871 aa  300  9e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  35.57 
 
 
748 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  35.47 
 
 
907 aa  299  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  36.02 
 
 
734 aa  296  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  28.1 
 
 
869 aa  295  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  27.67 
 
 
923 aa  295  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  36.9 
 
 
785 aa  295  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  34.59 
 
 
572 aa  294  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  35.65 
 
 
794 aa  294  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  34.92 
 
 
756 aa  293  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  35.1 
 
 
788 aa  292  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  28.62 
 
 
895 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>