More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4492 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  52.71 
 
 
907 aa  798    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  53.43 
 
 
865 aa  805    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  52.22 
 
 
885 aa  793    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  99.88 
 
 
834 aa  1706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 
834 aa  1707    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  99.76 
 
 
834 aa  1704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  41.88 
 
 
975 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  42.44 
 
 
886 aa  538  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  41.38 
 
 
901 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  35.04 
 
 
968 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  33.45 
 
 
910 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  32.25 
 
 
855 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  33.41 
 
 
890 aa  389  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  33.55 
 
 
845 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  33.25 
 
 
845 aa  362  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  33.66 
 
 
912 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  33.51 
 
 
843 aa  353  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  32.62 
 
 
846 aa  349  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  32.93 
 
 
826 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  31.42 
 
 
851 aa  334  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  31.15 
 
 
853 aa  332  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  31.7 
 
 
822 aa  324  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  30.26 
 
 
871 aa  323  6e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  32.21 
 
 
952 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  29.81 
 
 
853 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  30.15 
 
 
920 aa  318  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  28.96 
 
 
869 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  29.76 
 
 
875 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  31.1 
 
 
885 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  32.94 
 
 
889 aa  310  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  31.63 
 
 
924 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  30.61 
 
 
941 aa  308  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  30.22 
 
 
837 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  28.87 
 
 
923 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  28.54 
 
 
853 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  28.1 
 
 
853 aa  300  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  29.15 
 
 
892 aa  299  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  31.75 
 
 
1284 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  30.96 
 
 
918 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  29.22 
 
 
1074 aa  289  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  29.54 
 
 
840 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  29.18 
 
 
1057 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  29.92 
 
 
891 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  29.02 
 
 
1057 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  34.41 
 
 
661 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  34.22 
 
 
661 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  34.03 
 
 
661 aa  283  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  34.03 
 
 
661 aa  283  9e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  34.03 
 
 
661 aa  283  9e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  34.03 
 
 
661 aa  283  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  34.22 
 
 
661 aa  283  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  34.03 
 
 
661 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  28.51 
 
 
1063 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  31.61 
 
 
1284 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  28.82 
 
 
852 aa  281  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  28.27 
 
 
1059 aa  281  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  33.88 
 
 
613 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  32.64 
 
 
618 aa  280  8e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  28.39 
 
 
1063 aa  279  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  28.39 
 
 
1063 aa  279  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  29 
 
 
850 aa  278  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  29.14 
 
 
895 aa  278  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  34.77 
 
 
616 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  32.64 
 
 
618 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  28.43 
 
 
895 aa  271  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  32.64 
 
 
614 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  28.07 
 
 
895 aa  269  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  28.57 
 
 
868 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  28.31 
 
 
895 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  27.15 
 
 
958 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  31.16 
 
 
703 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  30.57 
 
 
898 aa  262  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  28.01 
 
 
911 aa  259  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  27.25 
 
 
850 aa  257  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  28.49 
 
 
918 aa  257  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  27.78 
 
 
850 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  27.78 
 
 
850 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  27.43 
 
 
957 aa  250  8e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  27.18 
 
 
843 aa  244  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  28.24 
 
 
842 aa  243  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  27.19 
 
 
843 aa  243  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  27.5 
 
 
956 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  27.5 
 
 
956 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  28.89 
 
 
1019 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  27.97 
 
 
1019 aa  237  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  27.25 
 
 
1048 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  27.78 
 
 
730 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  27.29 
 
 
955 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  32.43 
 
 
748 aa  231  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  27.41 
 
 
862 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  26.22 
 
 
838 aa  225  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  26.6 
 
 
862 aa  220  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  25.76 
 
 
933 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  29.54 
 
 
928 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  29.6 
 
 
841 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  29.6 
 
 
841 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  25.77 
 
 
908 aa  212  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  31.32 
 
 
767 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  29.6 
 
 
841 aa  211  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  31.49 
 
 
767 aa  210  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>