More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2648 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  51.74 
 
 		 957 aa  910    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  99.91 
 
 		 1063 aa  2173    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  46.32 
 
 		 961 aa  711    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  94.07 
 
 		 1057 aa  1932    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  40.65 
 
 		 958 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  61.68 
 
 		 895 aa  1109    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  62.35 
 
 		 868 aa  1085    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  92.38 
 
 		 1059 aa  1866    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  50.67 
 
 		 843 aa  775    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  64.93 
 
 		 895 aa  1120    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  64.93 
 
 		 895 aa  1117    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  67.79 
 
 		 853 aa  1191    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  66.71 
 
 		 853 aa  1146    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  82.34 
 
 		 1074 aa  1719    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  68.37 
 
 		 892 aa  1171    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  62.92 
 
 		 923 aa  1192    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  48.2 
 
 		 890 aa  746    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  84.94 
 
 		 730 aa  1266    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  49.22 
 
 		 910 aa  832    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  66.71 
 
 		 853 aa  1164    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  49.2 
 
 		 780 aa  673    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  49.07 
 
 		 780 aa  671    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  50.55 
 
 		 843 aa  770    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  63.85 
 
 		 850 aa  1085    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  98.68 
 
 		 1063 aa  2151    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  53.19 
 
 		 850 aa  859    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  43.8 
 
 		 928 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  46.59 
 
 		 869 aa  703    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  46.84 
 
 		 875 aa  706    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  47.32 
 
 		 871 aa  712    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  64.45 
 
 		 852 aa  1109    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  64.81 
 
 		 895 aa  1113    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  67.57 
 
 		 847 aa  973    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 1063 aa  2175    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  53.31 
 
 		 850 aa  864    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  53.19 
 
 		 850 aa  859    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  48.24 
 
 		 855 aa  777    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  93.79 
 
 		 1057 aa  1931    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  45.15 
 
 		 835 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  65.49 
 
 		 891 aa  1100    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4173  type VI secretion system Vgr family protein  44.94 
 
 		 784 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  40.69 
 
 		 912 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  31.23 
 
 		 975 aa  403  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  29.82 
 
 		 968 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  30.8 
 
 		 911 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  31.28 
 
 		 851 aa  373  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  31.76 
 
 		 853 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  29.06 
 
 		 933 aa  356  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  31.87 
 
 		 898 aa  350  7e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  30.97 
 
 		 918 aa  349  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  30.92 
 
 		 886 aa  342  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  30.65 
 
 		 901 aa  339  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  28.34 
 
 		 1094 aa  319  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  29.06 
 
 		 902 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  29.05 
 
 		 920 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  29.01 
 
 		 845 aa  312  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  33.94 
 
 		 616 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  28.45 
 
 		 845 aa  304  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  29.31 
 
 		 837 aa  302  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  30.64 
 
 		 906 aa  300  9e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  28.91 
 
 		 918 aa  299  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  29.55 
 
 		 847 aa  298  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  28.35 
 
 		 928 aa  296  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  28.32 
 
 		 822 aa  296  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  28.02 
 
 		 979 aa  296  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  30.18 
 
 		 906 aa  296  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  29.29 
 
 		 885 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  33.7 
 
 		 618 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  32.2 
 
 		 618 aa  293  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  28.36 
 
 		 941 aa  291  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  27.84 
 
 		 912 aa  291  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  28.21 
 
 		 1284 aa  291  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  31.72 
 
 		 613 aa  290  8e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  28.42 
 
 		 843 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  28.39 
 
 		 1048 aa  287  8e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  27.94 
 
 		 1114 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  29.11 
 
 		 922 aa  283  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  28.91 
 
 		 922 aa  282  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  32.36 
 
 		 614 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  29.31 
 
 		 920 aa  281  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  32.78 
 
 		 661 aa  281  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  28.57 
 
 		 952 aa  281  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  26.73 
 
 		 840 aa  280  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  28.79 
 
 		 1284 aa  280  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1019 aa  279  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  32.42 
 
 		 661 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  32.42 
 
 		 661 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  32.42 
 
 		 661 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  32.42 
 
 		 661 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  32.6 
 
 		 661 aa  279  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  32.42 
 
 		 661 aa  278  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  28.77 
 
 		 842 aa  277  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1019 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  28.84 
 
 		 834 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  28.84 
 
 		 834 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1111 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  28.51 
 
 		 1111 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  32.6 
 
 		 661 aa  273  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  28.7 
 
 		 920 aa  273  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  28.72 
 
 		 834 aa  273  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>