More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0006 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  65.3 
 
 		 1059 aa  1120    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  61.24 
 
 		 895 aa  1046    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  53.74 
 
 		 957 aa  873    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  60.27 
 
 		 850 aa  1020    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  49.57 
 
 		 850 aa  805    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  59.74 
 
 		 843 aa  971    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  63.29 
 
 		 853 aa  1089    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  60.21 
 
 		 843 aa  971    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  60.54 
 
 		 853 aa  1055    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  61.01 
 
 		 853 aa  1080    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  64.81 
 
 		 1063 aa  1119    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  64.81 
 
 		 1063 aa  1119    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  61.31 
 
 		 895 aa  1057    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  65.18 
 
 		 1074 aa  1129    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  62.21 
 
 		 892 aa  1055    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  63.86 
 
 		 923 aa  1089    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  48.81 
 
 		 890 aa  776    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  50.48 
 
 		 910 aa  848    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  65.05 
 
 		 1057 aa  1142    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  62.73 
 
 		 868 aa  1058    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 852 aa  1763    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  66.62 
 
 		 730 aa  1005    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  49.57 
 
 		 850 aa  802    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  61.33 
 
 		 895 aa  1052    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  44.76 
 
 		 928 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  43.8 
 
 		 869 aa  678    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  42.94 
 
 		 875 aa  665    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  43.83 
 
 		 871 aa  665    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  61.21 
 
 		 895 aa  1050    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  66.21 
 
 		 847 aa  938    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  64.69 
 
 		 1063 aa  1117    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  49.57 
 
 		 850 aa  802    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  48.82 
 
 		 855 aa  812    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  65.3 
 
 		 1057 aa  1125    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  48.79 
 
 		 835 aa  771    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  61.14 
 
 		 891 aa  1036    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  42 
 
 		 961 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  42.35 
 
 		 912 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  44.24 
 
 		 780 aa  582  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  44.11 
 
 		 780 aa  581  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4173  type VI secretion system Vgr family protein  42.86 
 
 		 784 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  38.54 
 
 		 958 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  32.34 
 
 		 851 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  31.58 
 
 		 853 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  30.97 
 
 		 911 aa  345  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  30.46 
 
 		 901 aa  342  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  30.97 
 
 		 886 aa  340  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  28.91 
 
 		 918 aa  340  9e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  30.57 
 
 		 898 aa  338  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  30.68 
 
 		 975 aa  330  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  29.55 
 
 		 885 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  29.39 
 
 		 918 aa  322  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  29.64 
 
 		 837 aa  319  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  28.68 
 
 		 845 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  28.9 
 
 		 845 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  29.44 
 
 		 933 aa  311  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  28.88 
 
 		 843 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  30.05 
 
 		 906 aa  303  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  29.07 
 
 		 968 aa  301  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  33.88 
 
 		 616 aa  300  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  29.73 
 
 		 906 aa  298  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  28.81 
 
 		 952 aa  295  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  33.58 
 
 		 618 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  26.92 
 
 		 1094 aa  292  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  28.46 
 
 		 822 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  33.4 
 
 		 613 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  27.67 
 
 		 924 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  29.17 
 
 		 834 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  32.9 
 
 		 618 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  29.17 
 
 		 834 aa  281  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  29.17 
 
 		 834 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  32.14 
 
 		 661 aa  280  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  31.96 
 
 		 661 aa  277  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 		 661 aa  277  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 		 661 aa  277  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 		 661 aa  277  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 		 661 aa  277  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  31.6 
 
 		 661 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  26.91 
 
 		 920 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  28.39 
 
 		 885 aa  275  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  32.14 
 
 		 661 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  29.44 
 
 		 920 aa  272  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  29.62 
 
 		 920 aa  272  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  28.42 
 
 		 1284 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  33.21 
 
 		 703 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  27.18 
 
 		 928 aa  270  8.999999999999999e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  26.91 
 
 		 847 aa  270  8.999999999999999e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  31.57 
 
 		 614 aa  270  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  26.98 
 
 		 979 aa  268  4e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  26.52 
 
 		 840 aa  266  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 912 aa  265  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  26.9 
 
 		 838 aa  265  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  27.83 
 
 		 955 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  27.89 
 
 		 956 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  27.89 
 
 		 956 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  27.78 
 
 		 941 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  27.81 
 
 		 842 aa  260  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  27.82 
 
 		 826 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  26.59 
 
 		 1048 aa  260  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  28.45 
 
 		 902 aa  258  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>