More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4080 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  77.65 
 
 		 851 aa  1364    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 853 aa  1757    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  55.32 
 
 		 618 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  54.58 
 
 		 614 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  40.88 
 
 		 906 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  40.41 
 
 		 906 aa  581  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  53.32 
 
 		 613 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  53 
 
 		 618 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  52.45 
 
 		 616 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  36.17 
 
 		 921 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  36.6 
 
 		 926 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  36.6 
 
 		 926 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  36.3 
 
 		 926 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  36.04 
 
 		 928 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  36.04 
 
 		 928 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  36.11 
 
 		 871 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  45.91 
 
 		 661 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  45.33 
 
 		 661 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  45.33 
 
 		 661 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  45.33 
 
 		 661 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  45.33 
 
 		 661 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  45.14 
 
 		 661 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  45.33 
 
 		 661 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  36.58 
 
 		 869 aa  465  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  36.03 
 
 		 875 aa  466  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  45.33 
 
 		 661 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  32.93 
 
 		 902 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  44.79 
 
 		 703 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  35.45 
 
 		 927 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  34.7 
 
 		 922 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  33.94 
 
 		 922 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  30.98 
 
 		 958 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1582  Rhs element Vgr protein  35.42 
 
 		 858 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.371781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  31.81 
 
 		 901 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  33.94 
 
 		 975 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  31.71 
 
 		 886 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  31.54 
 
 		 1059 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  32.49 
 
 		 853 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  30.76 
 
 		 911 aa  375  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  30.94 
 
 		 923 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  32.11 
 
 		 1063 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  31.87 
 
 		 1063 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  31.87 
 
 		 1063 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  32.81 
 
 		 853 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  32.34 
 
 		 850 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  31.94 
 
 		 852 aa  369  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  31.18 
 
 		 1074 aa  369  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  31.84 
 
 		 1057 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  31.22 
 
 		 895 aa  366  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  31.91 
 
 		 1057 aa  366  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  32.17 
 
 		 979 aa  365  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  30.9 
 
 		 933 aa  363  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  31.53 
 
 		 892 aa  363  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  30.94 
 
 		 910 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  31.53 
 
 		 895 aa  362  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  31 
 
 		 891 aa  360  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  32.39 
 
 		 855 aa  360  7e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  30.89 
 
 		 895 aa  359  9e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  30.89 
 
 		 895 aa  360  9e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  31.36 
 
 		 850 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1019 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  30.72 
 
 		 842 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  31.48 
 
 		 850 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1019 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  31.48 
 
 		 850 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  31.41 
 
 		 868 aa  357  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  29.65 
 
 		 1048 aa  356  8.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  32.22 
 
 		 853 aa  353  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  31.27 
 
 		 956 aa  352  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  31.27 
 
 		 956 aa  352  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  29.95 
 
 		 862 aa  350  9e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  38.42 
 
 		 683 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  32.36 
 
 		 968 aa  347  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  30.38 
 
 		 955 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  38.42 
 
 		 683 aa  344  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  31.33 
 
 		 928 aa  343  5.999999999999999e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  29.17 
 
 		 862 aa  343  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  30.88 
 
 		 898 aa  340  5e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  29.98 
 
 		 1094 aa  334  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  29.83 
 
 		 838 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  32.75 
 
 		 822 aa  327  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  30.72 
 
 		 843 aa  327  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  31.15 
 
 		 834 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  38.88 
 
 		 509 aa  325  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  31.15 
 
 		 834 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  31.15 
 
 		 834 aa  324  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  31.89 
 
 		 730 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  34.05 
 
 		 841 aa  321  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  34.05 
 
 		 841 aa  320  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  30.84 
 
 		 918 aa  320  7.999999999999999e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  30.45 
 
 		 843 aa  317  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  28.29 
 
 		 908 aa  317  5e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  33.87 
 
 		 841 aa  317  7e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  31.24 
 
 		 890 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  29.52 
 
 		 957 aa  312  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  30.34 
 
 		 920 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  30.45 
 
 		 920 aa  310  8e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  33.84 
 
 		 847 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  34.76 
 
 		 741 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  35.58 
 
 		 907 aa  300  9e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>