More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0933 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  47.6 
 
 
895 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  49.87 
 
 
1057 aa  716    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  50.27 
 
 
1059 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  48.06 
 
 
853 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  47.2 
 
 
895 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  50.07 
 
 
961 aa  734    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  48.24 
 
 
853 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  47.73 
 
 
1074 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  48.86 
 
 
892 aa  670    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  48.21 
 
 
923 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  46.6 
 
 
928 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  100 
 
 
780 aa  1608    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  99.74 
 
 
780 aa  1607    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  49.02 
 
 
1063 aa  691    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  46.8 
 
 
895 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  46.87 
 
 
850 aa  643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  49.34 
 
 
1063 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  48.11 
 
 
853 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  47.2 
 
 
895 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  49.34 
 
 
1063 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  50.4 
 
 
1057 aa  698    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  48 
 
 
891 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  47.05 
 
 
868 aa  648    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  45.73 
 
 
912 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4173  type VI secretion system Vgr family protein  48.25 
 
 
784 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  44.65 
 
 
852 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  43.84 
 
 
957 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  48.46 
 
 
730 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  41.55 
 
 
850 aa  522  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  41.55 
 
 
850 aa  522  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  41.55 
 
 
850 aa  522  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  47.77 
 
 
847 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  40.81 
 
 
843 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  41.28 
 
 
843 aa  489  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  35.9 
 
 
869 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  36.67 
 
 
875 aa  450  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  37.12 
 
 
871 aa  451  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  35.93 
 
 
958 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  36.79 
 
 
835 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  34.7 
 
 
910 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 
855 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  32.59 
 
 
890 aa  353  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  28.17 
 
 
898 aa  226  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  27.43 
 
 
975 aa  209  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  26.47 
 
 
911 aa  209  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  27.64 
 
 
851 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  26.93 
 
 
834 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  27.13 
 
 
853 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  26.93 
 
 
834 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  26.81 
 
 
834 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  26.56 
 
 
918 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  27.84 
 
 
845 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  26.93 
 
 
886 aa  197  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  27.15 
 
 
845 aa  196  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  28.39 
 
 
1111 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  26.75 
 
 
1114 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  28.39 
 
 
1111 aa  194  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  26.23 
 
 
901 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  28.26 
 
 
1111 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  25.71 
 
 
933 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  24.83 
 
 
1094 aa  191  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  27.42 
 
 
847 aa  191  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  27.2 
 
 
1111 aa  190  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  28.24 
 
 
1019 aa  188  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  26.48 
 
 
906 aa  187  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  25.13 
 
 
968 aa  187  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  28.82 
 
 
1019 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  25.74 
 
 
906 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  28.24 
 
 
842 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  25.54 
 
 
912 aa  179  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  26.48 
 
 
922 aa  177  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  26.3 
 
 
843 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  26.44 
 
 
840 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  26.45 
 
 
922 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  25.07 
 
 
822 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  25.03 
 
 
837 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  25.13 
 
 
902 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  25.23 
 
 
920 aa  169  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  24.22 
 
 
928 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  26.2 
 
 
941 aa  167  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  26.19 
 
 
885 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  26.63 
 
 
846 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  26.29 
 
 
920 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  24.5 
 
 
895 aa  165  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  26.17 
 
 
920 aa  165  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  27.16 
 
 
703 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  26.19 
 
 
918 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  26.12 
 
 
849 aa  162  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  23.98 
 
 
862 aa  162  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  29.79 
 
 
962 aa  161  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  24.24 
 
 
1048 aa  161  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  27.37 
 
 
616 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  29.65 
 
 
661 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  25.89 
 
 
811 aa  159  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  24.2 
 
 
862 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  29.58 
 
 
661 aa  159  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  29.65 
 
 
661 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  29.65 
 
 
661 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  29.65 
 
 
661 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  29.24 
 
 
661 aa  159  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>