More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6418 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  46.46 
 
 		 908 aa  816    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  48.65 
 
 		 926 aa  735    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  49 
 
 		 928 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 956 aa  1966    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  48.76 
 
 		 921 aa  735    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1582  Rhs element Vgr protein  49.81 
 
 		 858 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.371781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  49 
 
 		 928 aa  739    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  45.77 
 
 		 922 aa  725    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  50.89 
 
 		 902 aa  880    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  46.15 
 
 		 926 aa  737    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  46.15 
 
 		 926 aa  737    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 956 aa  1966    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  45.44 
 
 		 922 aa  717    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  45.12 
 
 		 927 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  90.9 
 
 		 955 aa  1811    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3222  putative VGR-related protein  55 
 
 		 547 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000721759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  31.23 
 
 		 906 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  31.03 
 
 		 906 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  44.32 
 
 		 509 aa  379  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  31.27 
 
 		 853 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  31.08 
 
 		 851 aa  348  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  28.32 
 
 		 910 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1019 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1019 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  29.35 
 
 		 842 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  28.71 
 
 		 901 aa  301  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  28.32 
 
 		 869 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  28.79 
 
 		 871 aa  282  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  27.53 
 
 		 875 aa  280  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  25.58 
 
 		 958 aa  279  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  27.29 
 
 		 886 aa  277  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  28.47 
 
 		 855 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  27.78 
 
 		 1057 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  28.23 
 
 		 1057 aa  259  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  28.66 
 
 		 968 aa  258  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  27.6 
 
 		 1074 aa  258  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  27.66 
 
 		 852 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  28.89 
 
 		 1059 aa  253  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  27.71 
 
 		 975 aa  251  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  28.08 
 
 		 1063 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  28.08 
 
 		 1063 aa  249  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  28.11 
 
 		 1063 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  26.95 
 
 		 850 aa  248  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  25.6 
 
 		 923 aa  248  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  27.5 
 
 		 853 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  27.07 
 
 		 892 aa  241  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  27.63 
 
 		 850 aa  240  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  27.99 
 
 		 865 aa  238  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  27.75 
 
 		 850 aa  237  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  27.75 
 
 		 850 aa  237  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  27.05 
 
 		 853 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  27.37 
 
 		 907 aa  233  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  27.5 
 
 		 834 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  27.5 
 
 		 834 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  27.5 
 
 		 834 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  26.71 
 
 		 868 aa  231  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  26.43 
 
 		 957 aa  227  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  27.31 
 
 		 979 aa  227  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 853 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  26.93 
 
 		 920 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  26.45 
 
 		 890 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  25.87 
 
 		 895 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  25.22 
 
 		 895 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  25.22 
 
 		 895 aa  222  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  26.64 
 
 		 885 aa  220  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  24.78 
 
 		 895 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  26.73 
 
 		 920 aa  219  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  27.1 
 
 		 843 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  26.5 
 
 		 891 aa  217  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 		 912 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  26.06 
 
 		 898 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  27.59 
 
 		 822 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  25.66 
 
 		 1048 aa  215  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  26.83 
 
 		 1284 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  24.32 
 
 		 911 aa  213  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  25.31 
 
 		 933 aa  212  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  26.97 
 
 		 918 aa  211  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  24.91 
 
 		 862 aa  211  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  26.86 
 
 		 846 aa  210  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  26.71 
 
 		 928 aa  209  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  27.22 
 
 		 843 aa  208  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  26.51 
 
 		 1284 aa  207  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  26.86 
 
 		 826 aa  206  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  26.97 
 
 		 843 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  27.68 
 
 		 730 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  28.48 
 
 		 952 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  26.33 
 
 		 885 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  26.71 
 
 		 849 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  26.29 
 
 		 918 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  27.11 
 
 		 840 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  26.32 
 
 		 920 aa  198  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  26.12 
 
 		 845 aa  199  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  25.96 
 
 		 837 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  25.53 
 
 		 845 aa  197  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  30.15 
 
 		 862 aa  196  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  24.81 
 
 		 927 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  27.16 
 
 		 618 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 661 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  28.75 
 
 		 661 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 661 aa  190  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>