More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00397 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  100 
 
 		 908 aa  1858    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  43.15 
 
 		 902 aa  680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  46.46 
 
 		 956 aa  807    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  46.46 
 
 		 956 aa  807    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  46.24 
 
 		 955 aa  805    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  41.27 
 
 		 926 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  41.62 
 
 		 928 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  41.4 
 
 		 928 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  41.49 
 
 		 921 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  40.04 
 
 		 926 aa  589  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  40.04 
 
 		 926 aa  589  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  39.96 
 
 		 927 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3222  putative VGR-related protein  72.05 
 
 		 547 aa  582  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000721759 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1582  Rhs element Vgr protein  42.97 
 
 		 858 aa  562  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.371781  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  41.04 
 
 		 922 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  41.16 
 
 		 922 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  48.14 
 
 		 509 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  31.6 
 
 		 906 aa  368  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  31.37 
 
 		 906 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  28.29 
 
 		 853 aa  317  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  27.41 
 
 		 851 aa  293  9e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  29.62 
 
 		 1019 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  29.41 
 
 		 842 aa  291  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1019 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  28.64 
 
 		 910 aa  258  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  27.85 
 
 		 958 aa  254  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  27.8 
 
 		 875 aa  249  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  27.14 
 
 		 869 aa  242  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  27.1 
 
 		 968 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  27.45 
 
 		 871 aa  239  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  27.14 
 
 		 855 aa  239  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  27.7 
 
 		 933 aa  233  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  26.88 
 
 		 850 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  27.44 
 
 		 892 aa  229  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  26.99 
 
 		 891 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  27.05 
 
 		 853 aa  228  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  26.37 
 
 		 895 aa  227  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  27.24 
 
 		 862 aa  227  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  27.61 
 
 		 852 aa  225  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  25.89 
 
 		 895 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  26.88 
 
 		 1048 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  26.77 
 
 		 923 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  26.5 
 
 		 886 aa  223  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  25.78 
 
 		 895 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  27.23 
 
 		 862 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  26.36 
 
 		 1057 aa  222  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  27.08 
 
 		 898 aa  221  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  27.13 
 
 		 1057 aa  221  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  25.67 
 
 		 895 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  26.39 
 
 		 1063 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  26.02 
 
 		 885 aa  219  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  26.39 
 
 		 1063 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  27.76 
 
 		 890 aa  217  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  27.96 
 
 		 822 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  26.48 
 
 		 1074 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  26.78 
 
 		 1059 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  25.91 
 
 		 843 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  26.04 
 
 		 1063 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  26.49 
 
 		 979 aa  214  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  25.6 
 
 		 850 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  26.63 
 
 		 975 aa  209  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  25.71 
 
 		 850 aa  208  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  25.71 
 
 		 850 aa  208  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  26.08 
 
 		 901 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  25.82 
 
 		 834 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  25.82 
 
 		 834 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  25.82 
 
 		 834 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  25.96 
 
 		 853 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  26.23 
 
 		 868 aa  204  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  27.98 
 
 		 918 aa  204  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  27.74 
 
 		 843 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  25.64 
 
 		 853 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  25.44 
 
 		 843 aa  201  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  26.47 
 
 		 928 aa  195  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  24.72 
 
 		 1094 aa  194  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  25.43 
 
 		 920 aa  194  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  26.48 
 
 		 840 aa  194  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  25.19 
 
 		 911 aa  192  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  26.23 
 
 		 826 aa  188  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  25.68 
 
 		 837 aa  187  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  26.27 
 
 		 730 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  29.03 
 
 		 920 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  25.95 
 
 		 918 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  25.86 
 
 		 847 aa  185  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  29.2 
 
 		 920 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  26.05 
 
 		 835 aa  183  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  27.85 
 
 		 845 aa  180  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  25.17 
 
 		 912 aa  180  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  25.17 
 
 		 889 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  27.39 
 
 		 845 aa  177  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  29.27 
 
 		 838 aa  177  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  28.92 
 
 		 613 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  26.97 
 
 		 841 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  26.97 
 
 		 841 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  25.81 
 
 		 928 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  28.61 
 
 		 849 aa  174  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  24.69 
 
 		 895 aa  171  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  27.5 
 
 		 616 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  27.95 
 
 		 618 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  25.32 
 
 		 846 aa  168  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>