More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4974 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  41.16 
 
 		 1057 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  40.15 
 
 		 895 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  39.65 
 
 		 957 aa  674    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 958 aa  1980    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  40.54 
 
 		 1063 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  44.25 
 
 		 869 aa  696    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  44.41 
 
 		 875 aa  699    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  44.03 
 
 		 871 aa  695    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  40.54 
 
 		 1063 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  40.27 
 
 		 1057 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  39.69 
 
 		 891 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  40.09 
 
 		 1074 aa  633  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  40.54 
 
 		 1063 aa  635  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  39.33 
 
 		 895 aa  632  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  39.44 
 
 		 895 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  40.2 
 
 		 1059 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  39.33 
 
 		 895 aa  628  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  40.68 
 
 		 853 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  40.72 
 
 		 923 aa  625  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  40.49 
 
 		 853 aa  619  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  39.6 
 
 		 853 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  39.69 
 
 		 892 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  39.46 
 
 		 850 aa  588  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  39 
 
 		 868 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  39.3 
 
 		 850 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  39.18 
 
 		 850 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  39.18 
 
 		 850 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  37.59 
 
 		 852 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  35.83 
 
 		 910 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  39.26 
 
 		 730 aa  499  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  36.7 
 
 		 843 aa  492  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  36.45 
 
 		 843 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  40 
 
 		 847 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  34.19 
 
 		 855 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  34.96 
 
 		 890 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  34.2 
 
 		 961 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  33.99 
 
 		 835 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  32.34 
 
 		 851 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  35.02 
 
 		 780 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  30.98 
 
 		 853 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  29.98 
 
 		 901 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  34.76 
 
 		 780 aa  399  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  30.58 
 
 		 911 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  31.93 
 
 		 928 aa  383  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  29.57 
 
 		 886 aa  379  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4173  type VI secretion system Vgr family protein  33.21 
 
 		 784 aa  360  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  30.77 
 
 		 912 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  29.96 
 
 		 975 aa  359  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  29.51 
 
 		 1094 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  31.17 
 
 		 898 aa  353  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  31.02 
 
 		 933 aa  350  6e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  29.61 
 
 		 968 aa  336  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  28.83 
 
 		 906 aa  335  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  28.95 
 
 		 906 aa  335  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  29.39 
 
 		 918 aa  330  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  26.94 
 
 		 902 aa  318  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  29.9 
 
 		 847 aa  318  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  30.14 
 
 		 922 aa  317  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  29.66 
 
 		 922 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  33.7 
 
 		 618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  34.52 
 
 		 618 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  29.82 
 
 		 979 aa  307  8.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  34.3 
 
 		 613 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  29.09 
 
 		 928 aa  305  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  29.35 
 
 		 920 aa  302  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  29.35 
 
 		 920 aa  300  9e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  28.36 
 
 		 1111 aa  297  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1111 aa  294  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  28.24 
 
 		 1111 aa  294  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  28.88 
 
 		 1048 aa  294  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  29.12 
 
 		 1284 aa  292  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1019 aa  289  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  34.25 
 
 		 661 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  27.86 
 
 		 1111 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1019 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  34.07 
 
 		 661 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  28.7 
 
 		 1284 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  33.89 
 
 		 661 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  33.89 
 
 		 661 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  33.89 
 
 		 661 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  33.7 
 
 		 661 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  33.89 
 
 		 661 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  29.4 
 
 		 849 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  28.83 
 
 		 822 aa  284  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  26.1 
 
 		 955 aa  284  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  33.58 
 
 		 661 aa  283  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  25.41 
 
 		 838 aa  282  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  32.16 
 
 		 616 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  25.26 
 
 		 841 aa  280  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  25.5 
 
 		 841 aa  279  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  28.82 
 
 		 811 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  25.5 
 
 		 841 aa  279  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  28.75 
 
 		 845 aa  278  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  32.64 
 
 		 614 aa  277  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  26.4 
 
 		 842 aa  277  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  25.37 
 
 		 956 aa  273  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  25.37 
 
 		 956 aa  273  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  28.52 
 
 		 845 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  28.59 
 
 		 826 aa  270  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  27.07 
 
 		 895 aa  269  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>