More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1769 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  73.76 
 
 		 895 aa  1302    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  42.38 
 
 		 911 aa  681    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  100 
 
 		 1111 aa  2271    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  99.46 
 
 		 1111 aa  2254    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  74.33 
 
 		 1114 aa  1674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  96.58 
 
 		 1111 aa  2109    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  47.86 
 
 		 847 aa  694    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  99.64 
 
 		 1111 aa  2263    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  40.65 
 
 		 898 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  47.28 
 
 		 612 aa  512  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02036  Rhs element Vgr protein  47.86 
 
 		 587 aa  493  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372394  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  51.18 
 
 		 477 aa  446  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1019 aa  313  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  29.16 
 
 		 871 aa  308  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  28.26 
 
 		 958 aa  307  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  31.23 
 
 		 918 aa  304  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  28.49 
 
 		 869 aa  302  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  29.06 
 
 		 875 aa  301  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1019 aa  298  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  29.11 
 
 		 923 aa  295  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  28.79 
 
 		 1063 aa  293  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  28.56 
 
 		 1057 aa  293  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  28.79 
 
 		 1063 aa  293  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  28.91 
 
 		 1063 aa  293  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  28.1 
 
 		 1074 aa  290  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  27.29 
 
 		 853 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  28.51 
 
 		 851 aa  287  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  28.05 
 
 		 1057 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  27.65 
 
 		 892 aa  283  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  28.49 
 
 		 1059 aa  283  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  27.6 
 
 		 933 aa  280  9e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  27.5 
 
 		 868 aa  280  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  29.19 
 
 		 850 aa  277  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  29.81 
 
 		 920 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  29.63 
 
 		 920 aa  273  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  29.08 
 
 		 850 aa  273  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  29.08 
 
 		 850 aa  273  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  27.01 
 
 		 850 aa  270  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  27.85 
 
 		 853 aa  268  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  27.31 
 
 		 891 aa  265  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  27.22 
 
 		 853 aa  264  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  27.77 
 
 		 853 aa  262  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  27.1 
 
 		 895 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  29.13 
 
 		 979 aa  258  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  27.13 
 
 		 852 aa  258  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  26.75 
 
 		 895 aa  258  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  27.11 
 
 		 895 aa  258  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  28.66 
 
 		 927 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  27.05 
 
 		 895 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  27.85 
 
 		 957 aa  253  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  26.82 
 
 		 1094 aa  251  7e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  28.94 
 
 		 947 aa  251  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  29.04 
 
 		 849 aa  248  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  27.94 
 
 		 843 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  29.1 
 
 		 906 aa  245  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  28.99 
 
 		 906 aa  242  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  25.65 
 
 		 920 aa  234  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  26.86 
 
 		 961 aa  232  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  27.21 
 
 		 843 aa  231  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  27.32 
 
 		 1006 aa  230  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  25.7 
 
 		 886 aa  229  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1779  hypothetical protein  97.27 
 
 		 110 aa  226  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0350078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  27.77 
 
 		 842 aa  226  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  27.26 
 
 		 962 aa  225  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  29.51 
 
 		 942 aa  222  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  27.76 
 
 		 730 aa  219  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  25.81 
 
 		 901 aa  217  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  28.63 
 
 		 946 aa  217  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  28.63 
 
 		 946 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  28.07 
 
 		 928 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  28.53 
 
 		 946 aa  214  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  26.56 
 
 		 890 aa  212  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  26.87 
 
 		 1284 aa  211  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  25.86 
 
 		 968 aa  210  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  25.05 
 
 		 902 aa  209  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  27.84 
 
 		 843 aa  209  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  26.3 
 
 		 855 aa  210  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  26.01 
 
 		 835 aa  209  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  25.03 
 
 		 975 aa  207  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  25.46 
 
 		 885 aa  207  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  25.91 
 
 		 910 aa  206  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  24.77 
 
 		 1048 aa  205  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  27.36 
 
 		 926 aa  204  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  27.36 
 
 		 926 aa  204  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  25.21 
 
 		 838 aa  204  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  27.09 
 
 		 928 aa  204  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  25.09 
 
 		 822 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 921 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  25.75 
 
 		 981 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  27.03 
 
 		 926 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  26.98 
 
 		 928 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  25.5 
 
 		 841 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  28.19 
 
 		 780 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  28.07 
 
 		 780 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  26.87 
 
 		 927 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  25.56 
 
 		 845 aa  198  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  25.33 
 
 		 935 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 834 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 834 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  27.11 
 
 		 834 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>