More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00270 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  46.43 
 
 		 946 aa  705    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  95.98 
 
 		 892 aa  1301    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  48.31 
 
 		 918 aa  728    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  45.61 
 
 		 927 aa  732    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  42.73 
 
 		 933 aa  680    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  46.22 
 
 		 946 aa  703    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  46.22 
 
 		 946 aa  701    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  98.04 
 
 		 920 aa  1792    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 920 aa  1828    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  46.04 
 
 		 947 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  46.15 
 
 		 942 aa  716    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  96.64 
 
 		 849 aa  1539    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  31.94 
 
 		 911 aa  375  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  31.98 
 
 		 1094 aa  354  4e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  31.82 
 
 		 898 aa  341  5e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  34.17 
 
 		 979 aa  333  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  33.96 
 
 		 928 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  30.05 
 
 		 958 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  31.02 
 
 		 871 aa  320  9e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  31.07 
 
 		 869 aa  319  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  31 
 
 		 875 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  30.53 
 
 		 853 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  33.12 
 
 		 847 aa  313  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  29.63 
 
 		 1057 aa  312  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  30.24 
 
 		 851 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  29.09 
 
 		 1074 aa  297  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  29.47 
 
 		 1057 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  29.74 
 
 		 923 aa  293  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  29.11 
 
 		 1063 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  29 
 
 		 1063 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  29.56 
 
 		 868 aa  292  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  29.26 
 
 		 1063 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  28.81 
 
 		 1059 aa  289  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  29.46 
 
 		 891 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02060  Rhs element Vgr protein  96.6 
 
 		 221 aa  286  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  28.37 
 
 		 895 aa  281  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  28.74 
 
 		 853 aa  280  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  28.81 
 
 		 957 aa  279  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  28.65 
 
 		 850 aa  278  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1111 aa  278  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  29.52 
 
 		 895 aa  277  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  30.06 
 
 		 1111 aa  277  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  28.15 
 
 		 895 aa  277  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  28.9 
 
 		 853 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  30.58 
 
 		 1006 aa  276  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  29.79 
 
 		 962 aa  275  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  30.05 
 
 		 852 aa  275  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  28.15 
 
 		 895 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  28.11 
 
 		 895 aa  274  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  30.2 
 
 		 1111 aa  271  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  29.72 
 
 		 1111 aa  269  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  30.92 
 
 		 1114 aa  269  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  29 
 
 		 892 aa  269  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  28.86 
 
 		 853 aa  266  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  30.22 
 
 		 935 aa  260  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  30.27 
 
 		 730 aa  258  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  30.27 
 
 		 843 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  29.92 
 
 		 843 aa  252  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  28.6 
 
 		 955 aa  251  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  29.42 
 
 		 850 aa  251  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  29.42 
 
 		 850 aa  251  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  30.32 
 
 		 935 aa  251  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  30.32 
 
 		 935 aa  251  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0498  Rhs element Vgr protein  30.32 
 
 		 935 aa  251  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  29.53 
 
 		 850 aa  251  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1580  Rhs element Vgr protein  30.32 
 
 		 935 aa  250  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1606  Rhs element Vgr protein  30.21 
 
 		 935 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  30.66 
 
 		 935 aa  248  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  29.6 
 
 		 811 aa  248  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  29.63 
 
 		 932 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  27.6 
 
 		 902 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  30.09 
 
 		 984 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  28.22 
 
 		 975 aa  233  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  26.99 
 
 		 956 aa  233  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  26.99 
 
 		 956 aa  233  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  26.9 
 
 		 910 aa  232  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  27.26 
 
 		 901 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  29.81 
 
 		 613 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  28.27 
 
 		 886 aa  228  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  29.67 
 
 		 618 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  30.12 
 
 		 906 aa  225  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  30.12 
 
 		 906 aa  224  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  26.35 
 
 		 968 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  28.57 
 
 		 981 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  28.78 
 
 		 847 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  27.21 
 
 		 855 aa  217  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  29.05 
 
 		 683 aa  213  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  29.98 
 
 		 683 aa  210  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  30.13 
 
 		 616 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  29.21 
 
 		 661 aa  207  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  29.21 
 
 		 661 aa  207  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  29.21 
 
 		 661 aa  207  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  29.21 
 
 		 661 aa  207  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  30.56 
 
 		 618 aa  207  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  29.21 
 
 		 661 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  28.3 
 
 		 890 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  29.53 
 
 		 661 aa  207  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  30.77 
 
 		 661 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  29.04 
 
 		 922 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  30.77 
 
 		 661 aa  205  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>