More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2225 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  45.38 
 
 
853 aa  685    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  43.65 
 
 
957 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  45.05 
 
 
850 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  45.73 
 
 
853 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  46 
 
 
895 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  45.88 
 
 
895 aa  692    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  44.35 
 
 
1059 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  45.02 
 
 
1063 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  58.18 
 
 
843 aa  935    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  45.64 
 
 
895 aa  687    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  45.52 
 
 
1057 aa  702    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  44.59 
 
 
1074 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  46.15 
 
 
892 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  46.34 
 
 
923 aa  709    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  45.02 
 
 
1063 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  43.63 
 
 
868 aa  643    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  44.63 
 
 
853 aa  670    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  57.25 
 
 
843 aa  919    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  45.52 
 
 
895 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  45.15 
 
 
1063 aa  670    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  45.88 
 
 
1057 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  48.73 
 
 
852 aa  764    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
835 aa  1719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  46.22 
 
 
891 aa  676    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  43.59 
 
 
850 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  43.47 
 
 
850 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  43.47 
 
 
850 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  44.1 
 
 
730 aa  571  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  44.97 
 
 
847 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  37.87 
 
 
910 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  38.46 
 
 
961 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  37.57 
 
 
928 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  37.75 
 
 
871 aa  474  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  36.27 
 
 
890 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  37 
 
 
869 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  35.57 
 
 
855 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  36.37 
 
 
875 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  35.67 
 
 
912 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  34.23 
 
 
958 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4173  type VI secretion system Vgr family protein  37.19 
 
 
784 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  36.65 
 
 
780 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  36.65 
 
 
780 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  27.88 
 
 
851 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  28.13 
 
 
975 aa  253  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  28.59 
 
 
886 aa  250  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  28.52 
 
 
901 aa  249  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  28.27 
 
 
837 aa  241  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  27.87 
 
 
885 aa  239  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  27.04 
 
 
898 aa  235  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  26.21 
 
 
853 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  27.84 
 
 
918 aa  226  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  25.65 
 
 
933 aa  224  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  29.22 
 
 
952 aa  221  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  25.9 
 
 
911 aa  218  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  28.36 
 
 
924 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  25.58 
 
 
918 aa  211  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  26.22 
 
 
822 aa  207  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  25.71 
 
 
847 aa  207  8e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  25.86 
 
 
845 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  25.42 
 
 
920 aa  204  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  26.91 
 
 
928 aa  204  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  26.84 
 
 
1111 aa  203  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  26.68 
 
 
979 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  26.52 
 
 
1019 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  26.36 
 
 
906 aa  200  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  26.33 
 
 
1111 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  26.44 
 
 
1111 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  26.18 
 
 
1111 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  26 
 
 
906 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  25.28 
 
 
1094 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  26.62 
 
 
885 aa  196  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  25.5 
 
 
845 aa  194  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  25.99 
 
 
907 aa  193  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  25.99 
 
 
865 aa  193  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  25 
 
 
843 aa  193  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  27.35 
 
 
920 aa  193  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  24.67 
 
 
968 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  26.1 
 
 
834 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  25.68 
 
 
1019 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  25.97 
 
 
834 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  25.97 
 
 
834 aa  190  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  24.74 
 
 
955 aa  190  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  26.25 
 
 
908 aa  190  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  26.3 
 
 
782 aa  189  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  26.83 
 
 
1114 aa  188  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  26.85 
 
 
920 aa  188  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  23.92 
 
 
956 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  25.99 
 
 
842 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  23.92 
 
 
956 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  26.62 
 
 
832 aa  187  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  24.94 
 
 
922 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  25.83 
 
 
941 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  26.38 
 
 
1284 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  26.27 
 
 
782 aa  185  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  25.8 
 
 
900 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  25.92 
 
 
782 aa  183  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  26.56 
 
 
849 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  25.43 
 
 
922 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  24.93 
 
 
1048 aa  180  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  27.58 
 
 
926 aa  180  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>