More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01970 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  100 
 
 		 898 aa  1826    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  46.33 
 
 		 911 aa  801    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  43.01 
 
 		 847 aa  558  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  38.4 
 
 		 895 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  40.54 
 
 		 1111 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  40.65 
 
 		 1111 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  40.54 
 
 		 1111 aa  532  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  40.4 
 
 		 1111 aa  532  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  39.3 
 
 		 1114 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  42.53 
 
 		 612 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  34.9 
 
 		 918 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  33.49 
 
 		 871 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02036  Rhs element Vgr protein  42.96 
 
 		 587 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  32.94 
 
 		 869 aa  376  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  32.57 
 
 		 875 aa  376  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  31.17 
 
 		 958 aa  366  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  30.79 
 
 		 895 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  30.38 
 
 		 895 aa  364  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  30.49 
 
 		 895 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  30.68 
 
 		 895 aa  362  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  31.99 
 
 		 1063 aa  360  9e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  31.75 
 
 		 1063 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  31.75 
 
 		 1063 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  30.39 
 
 		 892 aa  355  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  30.45 
 
 		 891 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  30.4 
 
 		 1074 aa  354  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  31.27 
 
 		 1057 aa  351  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  31.03 
 
 		 1057 aa  351  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  31.63 
 
 		 1059 aa  350  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  30.88 
 
 		 853 aa  350  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  29.71 
 
 		 923 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  30.57 
 
 		 852 aa  343  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  30.68 
 
 		 850 aa  343  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  31.7 
 
 		 851 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  29.27 
 
 		 853 aa  342  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  30.83 
 
 		 933 aa  340  9e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  32.19 
 
 		 920 aa  337  5e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  30.72 
 
 		 850 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  29.15 
 
 		 853 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  32.19 
 
 		 920 aa  336  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  29.6 
 
 		 853 aa  335  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  31 
 
 		 850 aa  334  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  31 
 
 		 850 aa  334  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  29.68 
 
 		 868 aa  333  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  29.67 
 
 		 957 aa  332  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  30.6 
 
 		 979 aa  319  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  31.89 
 
 		 849 aa  313  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  42.55 
 
 		 477 aa  312  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  30.13 
 
 		 910 aa  308  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  29.48 
 
 		 1094 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  29.61 
 
 		 890 aa  303  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  31.64 
 
 		 730 aa  302  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  31.26 
 
 		 928 aa  302  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  29.89 
 
 		 855 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  30.13 
 
 		 906 aa  282  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  30.37 
 
 		 906 aa  279  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  28.23 
 
 		 843 aa  278  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  27.3 
 
 		 843 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  30.57 
 
 		 834 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  30.57 
 
 		 834 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  30.45 
 
 		 834 aa  266  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  28.38 
 
 		 886 aa  263  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  28.16 
 
 		 901 aa  263  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  29.96 
 
 		 847 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  31.73 
 
 		 616 aa  252  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  28.47 
 
 		 975 aa  251  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  29.44 
 
 		 946 aa  250  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  29.44 
 
 		 946 aa  250  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  28.62 
 
 		 920 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  28.03 
 
 		 968 aa  248  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  29.34 
 
 		 946 aa  247  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  28.61 
 
 		 885 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  28.99 
 
 		 907 aa  244  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  28.06 
 
 		 927 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  29.88 
 
 		 942 aa  243  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  26.92 
 
 		 835 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  30.13 
 
 		 618 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  28.2 
 
 		 885 aa  237  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  26.52 
 
 		 961 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  30.19 
 
 		 614 aa  233  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  30.3 
 
 		 661 aa  233  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  26.18 
 
 		 955 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  28.75 
 
 		 845 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  26.2 
 
 		 902 aa  232  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  28.03 
 
 		 1006 aa  231  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  27.04 
 
 		 912 aa  231  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  30.3 
 
 		 661 aa  231  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  28.92 
 
 		 947 aa  230  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  29.92 
 
 		 661 aa  229  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  29.92 
 
 		 661 aa  229  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  29.92 
 
 		 661 aa  229  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  30.3 
 
 		 661 aa  229  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  29.92 
 
 		 661 aa  229  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  29.73 
 
 		 661 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  26.71 
 
 		 1048 aa  228  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  30.36 
 
 		 892 aa  227  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  27.76 
 
 		 928 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  27.37 
 
 		 908 aa  226  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  28.83 
 
 		 926 aa  226  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  28.83 
 
 		 926 aa  226  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>