More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7609 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  68.47 
 
 
946 aa  1256    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  68.47 
 
 
946 aa  1254    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  68.58 
 
 
946 aa  1258    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  62.61 
 
 
927 aa  1122    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  46.32 
 
 
920 aa  707    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
947 aa  1904    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  70.87 
 
 
942 aa  1286    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  45.75 
 
 
920 aa  696    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  45.95 
 
 
849 aa  637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  39.02 
 
 
933 aa  572  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  38.28 
 
 
918 aa  559  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  44.61 
 
 
892 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  29.02 
 
 
911 aa  296  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  28.81 
 
 
871 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  29.1 
 
 
869 aa  282  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  28.93 
 
 
875 aa  277  7e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  27.91 
 
 
958 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  29.08 
 
 
1094 aa  263  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  27.32 
 
 
853 aa  259  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  27.29 
 
 
851 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  28.94 
 
 
1111 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  28.94 
 
 
1111 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  28.72 
 
 
1111 aa  241  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  28.39 
 
 
895 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  30.09 
 
 
1114 aa  238  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  26.66 
 
 
1057 aa  237  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  26.26 
 
 
850 aa  237  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  28.71 
 
 
1111 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  30.41 
 
 
979 aa  234  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  29.62 
 
 
1006 aa  231  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  29.94 
 
 
928 aa  230  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  26.47 
 
 
1074 aa  229  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  29.46 
 
 
847 aa  227  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  29.38 
 
 
962 aa  226  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  28.63 
 
 
935 aa  225  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  27.73 
 
 
984 aa  225  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  25.99 
 
 
1059 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  25.91 
 
 
1057 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  26.21 
 
 
957 aa  221  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  29.09 
 
 
898 aa  220  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  25.4 
 
 
1063 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  25.03 
 
 
853 aa  217  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  25.29 
 
 
1063 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  25.19 
 
 
1063 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  25.54 
 
 
910 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  25.94 
 
 
852 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  25.32 
 
 
923 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  29.02 
 
 
981 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  28.67 
 
 
935 aa  211  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  26.23 
 
 
853 aa  211  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0498  Rhs element Vgr protein  28.67 
 
 
935 aa  211  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  28.67 
 
 
935 aa  211  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  28.67 
 
 
935 aa  211  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1606  Rhs element Vgr protein  28.78 
 
 
935 aa  210  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  28.13 
 
 
850 aa  210  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  28.47 
 
 
850 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  28.28 
 
 
932 aa  208  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  28.47 
 
 
850 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1580  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 
935 aa  208  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  26.36 
 
 
902 aa  207  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  24.9 
 
 
853 aa  205  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  28.43 
 
 
906 aa  204  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  25.05 
 
 
892 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  28.41 
 
 
906 aa  202  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  25.82 
 
 
895 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  25.71 
 
 
895 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  25.71 
 
 
895 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  26.22 
 
 
730 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  29.38 
 
 
683 aa  197  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  27.35 
 
 
618 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  26.08 
 
 
843 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  24.68 
 
 
855 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  24.92 
 
 
895 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  25.08 
 
 
891 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  25.66 
 
 
955 aa  191  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  27.85 
 
 
613 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  28.73 
 
 
683 aa  190  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  25.4 
 
 
975 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  26.23 
 
 
956 aa  189  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  26.23 
 
 
956 aa  189  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  23.5 
 
 
868 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  25.25 
 
 
901 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  25.41 
 
 
843 aa  178  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  27.09 
 
 
616 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  25.03 
 
 
890 aa  177  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  26.16 
 
 
614 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  25.16 
 
 
886 aa  175  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  27.41 
 
 
922 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  26.18 
 
 
741 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  27.92 
 
 
618 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  27.52 
 
 
811 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  28.32 
 
 
921 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  28.07 
 
 
928 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  28.18 
 
 
928 aa  171  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  26.93 
 
 
689 aa  171  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  25.2 
 
 
822 aa  171  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02060  Rhs element Vgr protein  57.24 
 
 
221 aa  171  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  28.18 
 
 
926 aa  170  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  29.79 
 
 
684 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  26.53 
 
 
922 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>