More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04253 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02036  Rhs element Vgr protein  71.72 
 
 		 587 aa  789    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372394  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 612 aa  1217    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  77.25 
 
 		 477 aa  668    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  72.45 
 
 		 847 aa  850    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  47.99 
 
 		 1111 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  46.41 
 
 		 911 aa  508  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  46.87 
 
 		 1114 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  47.44 
 
 		 1111 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  47.28 
 
 		 1111 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  47.28 
 
 		 1111 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  44.37 
 
 		 895 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  42.53 
 
 		 898 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  30.88 
 
 		 869 aa  256  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  30.56 
 
 		 871 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  29.89 
 
 		 875 aa  247  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  31.7 
 
 		 933 aa  243  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  32.51 
 
 		 918 aa  238  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  29.18 
 
 		 1057 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  30.3 
 
 		 958 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  30.74 
 
 		 923 aa  231  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  29.18 
 
 		 1057 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  29.33 
 
 		 1063 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  28.86 
 
 		 1074 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  29.17 
 
 		 1063 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  29.02 
 
 		 1063 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  29.18 
 
 		 1059 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  30.85 
 
 		 892 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  29.88 
 
 		 853 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  29.51 
 
 		 850 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  27.79 
 
 		 853 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  28.66 
 
 		 895 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  28.5 
 
 		 895 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  28.5 
 
 		 895 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  27.99 
 
 		 853 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  29.49 
 
 		 850 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  29.18 
 
 		 895 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  29.49 
 
 		 850 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  29.49 
 
 		 850 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  29.02 
 
 		 891 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  29.63 
 
 		 853 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  26.6 
 
 		 852 aa  198  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  27.39 
 
 		 868 aa  196  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  28.39 
 
 		 851 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1019 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  30.56 
 
 		 842 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  28.15 
 
 		 1094 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1019 aa  184  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  28.01 
 
 		 811 aa  183  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  30.41 
 
 		 892 aa  180  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  30.41 
 
 		 920 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  28.03 
 
 		 843 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  29.03 
 
 		 968 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  29.97 
 
 		 920 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  28.19 
 
 		 957 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  30.12 
 
 		 927 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  28.49 
 
 		 928 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  29.77 
 
 		 849 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  28.63 
 
 		 979 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  29.54 
 
 		 845 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  28.59 
 
 		 902 aa  173  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  28.3 
 
 		 843 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  29.54 
 
 		 846 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  29.48 
 
 		 845 aa  170  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  29.2 
 
 		 947 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  28.52 
 
 		 730 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  27.34 
 
 		 1006 aa  164  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  27.29 
 
 		 962 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  26.98 
 
 		 838 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  26.03 
 
 		 835 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  27.83 
 
 		 1048 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  28.8 
 
 		 920 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  34.97 
 
 		 906 aa  153  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  28.68 
 
 		 928 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  34.97 
 
 		 906 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  28.81 
 
 		 847 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  26.05 
 
 		 855 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  29.36 
 
 		 921 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  27.41 
 
 		 822 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 		 961 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  29.07 
 
 		 926 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  29.26 
 
 		 901 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  28.83 
 
 		 928 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  28.03 
 
 		 841 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  28.68 
 
 		 942 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  29.38 
 
 		 1284 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  29.42 
 
 		 927 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  26.75 
 
 		 890 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  27.61 
 
 		 922 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  28.06 
 
 		 922 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  27.44 
 
 		 1284 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  26.32 
 
 		 886 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  28.59 
 
 		 926 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  28.59 
 
 		 926 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  27.51 
 
 		 910 aa  144  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1582  Rhs element Vgr protein  29.64 
 
 		 858 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.371781  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  33.64 
 
 		 841 aa  141  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  33.64 
 
 		 841 aa  141  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  29.37 
 
 		 843 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  27.73 
 
 		 862 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  27.77 
 
 		 955 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>