More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7612 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  74.33 
 
 
1111 aa  1631    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  41.88 
 
 
911 aa  662    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  74.33 
 
 
1111 aa  1629    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  45.84 
 
 
847 aa  662    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
1114 aa  2282    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  74.33 
 
 
1111 aa  1644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  71.41 
 
 
895 aa  1248    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  74.51 
 
 
1111 aa  1632    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  39.37 
 
 
898 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  46.87 
 
 
612 aa  510  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02036  Rhs element Vgr protein  46 
 
 
587 aa  469  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372394  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  48.28 
 
 
477 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  27.34 
 
 
1063 aa  284  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  27.34 
 
 
1063 aa  283  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  30.42 
 
 
918 aa  283  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  27.55 
 
 
1057 aa  282  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  27.34 
 
 
1063 aa  282  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  27.84 
 
 
871 aa  281  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  28.28 
 
 
853 aa  278  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 
875 aa  278  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  27 
 
 
869 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  27.79 
 
 
850 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  27.05 
 
 
1019 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  27.49 
 
 
1019 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  27.09 
 
 
1074 aa  275  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  26.97 
 
 
1057 aa  274  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  26.7 
 
 
1059 aa  270  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  26.98 
 
 
923 aa  270  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  26.91 
 
 
892 aa  270  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  26.27 
 
 
868 aa  267  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  26.4 
 
 
958 aa  265  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  26.69 
 
 
895 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  29.84 
 
 
920 aa  261  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  27.42 
 
 
851 aa  260  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  26.91 
 
 
891 aa  258  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  25.82 
 
 
853 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  25.71 
 
 
853 aa  255  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  26.28 
 
 
895 aa  255  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  29.74 
 
 
920 aa  254  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  26.19 
 
 
895 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  26.09 
 
 
895 aa  253  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  26.18 
 
 
853 aa  253  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 
933 aa  253  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  27.51 
 
 
850 aa  251  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  26.96 
 
 
1094 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  27.51 
 
 
850 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  27.51 
 
 
850 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  27.98 
 
 
843 aa  247  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  26.87 
 
 
957 aa  244  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  25.99 
 
 
852 aa  243  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  28.15 
 
 
979 aa  240  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  27.75 
 
 
927 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  29.76 
 
 
947 aa  237  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  27.36 
 
 
843 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  29.69 
 
 
849 aa  236  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  30.26 
 
 
942 aa  224  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  26.73 
 
 
962 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  26.65 
 
 
906 aa  221  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  26.69 
 
 
961 aa  220  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  26.49 
 
 
1006 aa  219  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  26.37 
 
 
906 aa  219  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  26.1 
 
 
968 aa  218  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  27.66 
 
 
928 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  28.97 
 
 
946 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  28.97 
 
 
946 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  25.78 
 
 
886 aa  213  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  28.86 
 
 
946 aa  212  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  25.65 
 
 
920 aa  209  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  26.97 
 
 
730 aa  208  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  25.6 
 
 
910 aa  208  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  25.53 
 
 
901 aa  208  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  25.28 
 
 
855 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  25.51 
 
 
975 aa  202  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  26.15 
 
 
1284 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  26.05 
 
 
890 aa  201  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  24.15 
 
 
902 aa  199  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  23.95 
 
 
841 aa  198  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  24.39 
 
 
841 aa  198  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  26.27 
 
 
842 aa  198  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  24.39 
 
 
841 aa  197  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  25.14 
 
 
885 aa  197  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  26.98 
 
 
935 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  24.53 
 
 
838 aa  196  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  25.84 
 
 
955 aa  194  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  26.02 
 
 
926 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  25.69 
 
 
845 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  24.84 
 
 
845 aa  191  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  25.91 
 
 
926 aa  190  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  25.91 
 
 
926 aa  190  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  25.06 
 
 
837 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  26.13 
 
 
921 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  25.41 
 
 
922 aa  189  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  26.7 
 
 
984 aa  189  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  25.51 
 
 
928 aa  189  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  25.51 
 
 
928 aa  189  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1779  hypothetical protein  80.91 
 
 
110 aa  188  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0350078  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  25.36 
 
 
918 aa  187  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  26.52 
 
 
932 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  26.55 
 
 
935 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  26.55 
 
 
935 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>