More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3479 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  87.68 
 
 		 845 aa  1547    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  43.08 
 
 		 952 aa  651    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  50.36 
 
 		 1284 aa  810    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  42.63 
 
 		 924 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  45.01 
 
 		 837 aa  698    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  44 
 
 		 840 aa  691    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  45.52 
 
 		 885 aa  695    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  44.92 
 
 		 826 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  75.68 
 
 		 843 aa  1324    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  42.32 
 
 		 822 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 845 aa  1748    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  52.09 
 
 		 1284 aa  843    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  53.55 
 
 		 846 aa  881    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  44.79 
 
 		 941 aa  701    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  44.79 
 
 		 918 aa  680    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  43.98 
 
 		 920 aa  714    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  43.61 
 
 		 889 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  41.42 
 
 		 912 aa  595  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  42.16 
 
 		 975 aa  568  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  41.7 
 
 		 886 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  40.87 
 
 		 901 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  36.18 
 
 		 1048 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  36.8 
 
 		 862 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  36.92 
 
 		 862 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  42.83 
 
 		 1057 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  45.6 
 
 		 676 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  42.93 
 
 		 1048 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  43.29 
 
 		 872 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  46.35 
 
 		 725 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  43.29 
 
 		 930 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  43.29 
 
 		 858 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  43.29 
 
 		 896 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  34.89 
 
 		 968 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  44.06 
 
 		 775 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  44.24 
 
 		 775 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  44.24 
 
 		 775 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  34.56 
 
 		 855 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  44.06 
 
 		 775 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  44.06 
 
 		 775 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  44.06 
 
 		 775 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  44.06 
 
 		 775 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  40.07 
 
 		 874 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  41.71 
 
 		 714 aa  415  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  40.07 
 
 		 916 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  40.07 
 
 		 922 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  41.49 
 
 		 724 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  41.32 
 
 		 743 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  40.68 
 
 		 729 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  40.69 
 
 		 729 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  42.86 
 
 		 540 aa  399  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  32.62 
 
 		 910 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  42.19 
 
 		 1981 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  35.15 
 
 		 890 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  39.42 
 
 		 730 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  38.86 
 
 		 794 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  34.24 
 
 		 865 aa  360  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  33.41 
 
 		 885 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  35.53 
 
 		 907 aa  357  6.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  33.97 
 
 		 834 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  33.97 
 
 		 834 aa  356  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  33.55 
 
 		 834 aa  356  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  29.58 
 
 		 838 aa  327  6e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  36.49 
 
 		 796 aa  319  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  34.13 
 
 		 841 aa  318  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  36.69 
 
 		 734 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  36.69 
 
 		 734 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  36.69 
 
 		 734 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  36.69 
 
 		 734 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  36.69 
 
 		 734 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  36.69 
 
 		 734 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  34.13 
 
 		 841 aa  318  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  36.69 
 
 		 731 aa  318  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  34.3 
 
 		 841 aa  317  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  36.69 
 
 		 731 aa  317  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  36.84 
 
 		 780 aa  315  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  28.99 
 
 		 852 aa  308  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  28.89 
 
 		 1057 aa  307  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  29.56 
 
 		 871 aa  306  9.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  28.39 
 
 		 1074 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  36.85 
 
 		 757 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  36.28 
 
 		 734 aa  302  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  36.23 
 
 		 778 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  28.17 
 
 		 1057 aa  301  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  36.21 
 
 		 734 aa  300  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  28.08 
 
 		 1059 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  28.45 
 
 		 1063 aa  299  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  28.45 
 
 		 1063 aa  299  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  29.21 
 
 		 869 aa  297  6e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  34.23 
 
 		 777 aa  296  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  28.1 
 
 		 1063 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  36.26 
 
 		 785 aa  296  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  35.95 
 
 		 794 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  29.32 
 
 		 875 aa  291  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  34.87 
 
 		 687 aa  289  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  29.99 
 
 		 895 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  27.11 
 
 		 853 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  35.36 
 
 		 792 aa  287  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  34.53 
 
 		 572 aa  286  8e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  30.37 
 
 		 891 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  34.49 
 
 		 756 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>