More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1827 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  63.99 
 
 
775 aa  668    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  63.99 
 
 
775 aa  668    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  61.93 
 
 
714 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  64.19 
 
 
775 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  64.19 
 
 
775 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
540 aa  1117    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  66.6 
 
 
725 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  61.48 
 
 
724 aa  668    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  66.41 
 
 
676 aa  713    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  63.99 
 
 
775 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  63.99 
 
 
775 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  90.22 
 
 
1981 aa  947    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  64.38 
 
 
775 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  46.99 
 
 
916 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  46.99 
 
 
922 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  46.99 
 
 
874 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  48.26 
 
 
1057 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  46.77 
 
 
794 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  48.85 
 
 
872 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  48.66 
 
 
930 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  48.66 
 
 
858 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  48.66 
 
 
896 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  47.18 
 
 
1048 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  44.99 
 
 
729 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  44.79 
 
 
729 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  45.19 
 
 
730 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  45.05 
 
 
743 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  42.88 
 
 
1048 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  42.83 
 
 
826 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  42.86 
 
 
845 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  42.86 
 
 
845 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  42.17 
 
 
822 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  42.67 
 
 
843 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  43.08 
 
 
730 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  42.31 
 
 
780 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  39.84 
 
 
838 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  39.84 
 
 
841 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  39.5 
 
 
907 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  39.84 
 
 
841 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  39.65 
 
 
841 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  41.91 
 
 
862 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  39.11 
 
 
756 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  38.92 
 
 
572 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  39.13 
 
 
778 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  39.73 
 
 
774 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  41.52 
 
 
862 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  38.57 
 
 
748 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  38.91 
 
 
792 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  41.15 
 
 
796 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  39.13 
 
 
794 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  38.54 
 
 
755 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  42.7 
 
 
734 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  42.7 
 
 
734 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  42.7 
 
 
734 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  42.7 
 
 
734 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  42.7 
 
 
734 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  42.7 
 
 
731 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  40.12 
 
 
785 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  42.7 
 
 
734 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  38.54 
 
 
788 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  40.83 
 
 
741 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  42.51 
 
 
731 aa  365  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  40.78 
 
 
646 aa  364  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  37.88 
 
 
777 aa  362  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  40.04 
 
 
741 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  38.84 
 
 
689 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  39.43 
 
 
643 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  38.11 
 
 
741 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  40.24 
 
 
734 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  38.88 
 
 
886 aa  358  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  39.65 
 
 
757 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  39.44 
 
 
901 aa  358  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  39.02 
 
 
689 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  39.12 
 
 
975 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  39.81 
 
 
1284 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  39.84 
 
 
734 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  40.91 
 
 
771 aa  348  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  39.21 
 
 
1284 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  36.48 
 
 
885 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  36.04 
 
 
889 aa  336  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  36.29 
 
 
920 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  40.56 
 
 
769 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  36.48 
 
 
918 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  36.48 
 
 
837 aa  335  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  37.47 
 
 
687 aa  326  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  36.2 
 
 
645 aa  320  5e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  34.27 
 
 
840 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  37.03 
 
 
712 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  35.18 
 
 
683 aa  307  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  33.4 
 
 
846 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  33.9 
 
 
683 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  35.93 
 
 
735 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  37.02 
 
 
767 aa  296  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  36.69 
 
 
618 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  37.11 
 
 
767 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  35.13 
 
 
661 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  34.01 
 
 
618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  32.93 
 
 
618 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  34.89 
 
 
952 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  35.28 
 
 
661 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>