More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0449 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  43.21 
 
 		 845 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  55.66 
 
 		 889 aa  917    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  56.39 
 
 		 920 aa  959    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  43.04 
 
 		 843 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  48.28 
 
 		 846 aa  807    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  56.43 
 
 		 918 aa  934    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  49.39 
 
 		 912 aa  797    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 840 aa  1734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  44 
 
 		 845 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  57.25 
 
 		 885 aa  942    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  42.91 
 
 		 1284 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  56.26 
 
 		 837 aa  935    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  41.93 
 
 		 1284 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  39.15 
 
 		 855 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  39.43 
 
 		 924 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  38.74 
 
 		 952 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  37.41 
 
 		 826 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  34.45 
 
 		 941 aa  492  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  32.97 
 
 		 822 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  33.63 
 
 		 975 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  32.1 
 
 		 901 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  32.79 
 
 		 886 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  31.57 
 
 		 1048 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  31 
 
 		 862 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  31.79 
 
 		 862 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  33.14 
 
 		 890 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  35 
 
 		 874 aa  342  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  35 
 
 		 916 aa  342  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  35 
 
 		 922 aa  342  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  35.42 
 
 		 724 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  36.72 
 
 		 775 aa  337  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  36.72 
 
 		 775 aa  337  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  36.72 
 
 		 775 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  36.72 
 
 		 775 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  36.72 
 
 		 775 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  36.72 
 
 		 775 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  36.54 
 
 		 775 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  30.37 
 
 		 968 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  36.29 
 
 		 725 aa  328  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  36.52 
 
 		 676 aa  327  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 910 aa  323  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  34.27 
 
 		 1057 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  34.03 
 
 		 872 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  34.03 
 
 		 858 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  34.03 
 
 		 896 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  34.03 
 
 		 930 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  33.85 
 
 		 1981 aa  311  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  33.87 
 
 		 714 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  34.27 
 
 		 540 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  33.22 
 
 		 1048 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  33.51 
 
 		 743 aa  303  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  33.69 
 
 		 729 aa  302  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  33.51 
 
 		 729 aa  300  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  32.62 
 
 		 730 aa  291  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  27.44 
 
 		 841 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  27.44 
 
 		 841 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  27.98 
 
 		 794 aa  287  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  28.27 
 
 		 853 aa  286  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  30.42 
 
 		 907 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  27.47 
 
 		 841 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  29.96 
 
 		 885 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  28.27 
 
 		 853 aa  280  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  27.49 
 
 		 853 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  26.96 
 
 		 1063 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  29.54 
 
 		 834 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  29.54 
 
 		 834 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  26.96 
 
 		 1063 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  29.54 
 
 		 834 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  27.07 
 
 		 838 aa  273  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  28.9 
 
 		 865 aa  273  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  26.15 
 
 		 1074 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  26.61 
 
 		 1063 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  26.53 
 
 		 869 aa  269  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  27.04 
 
 		 871 aa  267  5e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  27.13 
 
 		 923 aa  267  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  25.32 
 
 		 1057 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  25.44 
 
 		 1057 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  26.76 
 
 		 852 aa  262  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  26.24 
 
 		 1059 aa  260  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  27 
 
 		 895 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  26.1 
 
 		 875 aa  258  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  26.76 
 
 		 850 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  26.56 
 
 		 895 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  27.09 
 
 		 892 aa  253  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  26.45 
 
 		 895 aa  254  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  31.95 
 
 		 734 aa  252  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  31.95 
 
 		 734 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  31.95 
 
 		 734 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  31.95 
 
 		 734 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  31.95 
 
 		 734 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  31.95 
 
 		 731 aa  252  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  32.15 
 
 		 731 aa  252  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  27.81 
 
 		 853 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  30.66 
 
 		 756 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  31.76 
 
 		 734 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  27.43 
 
 		 851 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  26.08 
 
 		 868 aa  248  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  28.59 
 
 		 757 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  30.31 
 
 		 907 aa  247  8e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  30.31 
 
 		 774 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>