More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2595 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  49.94 
 
 
837 aa  791    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  50.43 
 
 
889 aa  783    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  45.41 
 
 
846 aa  705    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  48.67 
 
 
918 aa  782    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  48.69 
 
 
885 aa  795    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  49.7 
 
 
920 aa  802    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
912 aa  1899    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  49.39 
 
 
840 aa  816    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  40.9 
 
 
845 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  41.42 
 
 
845 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  39.17 
 
 
843 aa  557  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  34.87 
 
 
910 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  36.88 
 
 
1284 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  37.47 
 
 
952 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  37.04 
 
 
924 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  36.41 
 
 
1284 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  34.35 
 
 
941 aa  475  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  36.01 
 
 
826 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  33.03 
 
 
901 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  35.97 
 
 
886 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  33.37 
 
 
822 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  36.3 
 
 
975 aa  428  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  34.78 
 
 
890 aa  396  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  32.42 
 
 
855 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  29.42 
 
 
1048 aa  351  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  33.66 
 
 
834 aa  350  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  33.66 
 
 
834 aa  349  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  33.54 
 
 
834 aa  347  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  30.8 
 
 
968 aa  344  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  28.59 
 
 
862 aa  318  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  28.52 
 
 
862 aa  317  9e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  32.64 
 
 
907 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  31.75 
 
 
865 aa  314  5.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  31.99 
 
 
885 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  27.41 
 
 
1063 aa  287  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  27.3 
 
 
1063 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  27.19 
 
 
1063 aa  283  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  26.57 
 
 
1057 aa  283  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  26.63 
 
 
1074 aa  282  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  26.67 
 
 
1057 aa  280  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  26.75 
 
 
1059 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  26.46 
 
 
871 aa  272  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  30.74 
 
 
1057 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  26.07 
 
 
869 aa  264  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  31.13 
 
 
775 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  31.13 
 
 
775 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  31.13 
 
 
775 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  31.13 
 
 
775 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  31.13 
 
 
775 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  31.13 
 
 
775 aa  262  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  30.95 
 
 
775 aa  260  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  26.56 
 
 
852 aa  260  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  27.18 
 
 
875 aa  260  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  26.07 
 
 
868 aa  259  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  26.23 
 
 
853 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  25.76 
 
 
895 aa  255  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  30.09 
 
 
896 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  30.09 
 
 
858 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  30.09 
 
 
930 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  30.09 
 
 
872 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  25.08 
 
 
895 aa  254  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  25.08 
 
 
895 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  30.14 
 
 
1048 aa  251  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  24.77 
 
 
923 aa  250  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  29.2 
 
 
729 aa  250  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  27.83 
 
 
922 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  24.63 
 
 
958 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  27.83 
 
 
916 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  27.83 
 
 
874 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  30.12 
 
 
743 aa  249  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  28.75 
 
 
730 aa  249  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  25.19 
 
 
891 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  29.02 
 
 
729 aa  247  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  29.42 
 
 
794 aa  247  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  24.95 
 
 
895 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  25.03 
 
 
892 aa  242  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  25.71 
 
 
853 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  25.73 
 
 
850 aa  241  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  30.22 
 
 
714 aa  238  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  26 
 
 
838 aa  234  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  27.03 
 
 
850 aa  234  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  27.03 
 
 
850 aa  234  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  27.92 
 
 
1019 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  25.37 
 
 
853 aa  233  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  26.73 
 
 
850 aa  231  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  26.16 
 
 
957 aa  230  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  24.97 
 
 
724 aa  227  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  27.67 
 
 
1019 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  28.38 
 
 
676 aa  225  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  26.47 
 
 
956 aa  224  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  26.47 
 
 
956 aa  224  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  28.62 
 
 
841 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  28.45 
 
 
841 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  25.82 
 
 
843 aa  222  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  29.03 
 
 
1981 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  25.68 
 
 
843 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  28.74 
 
 
725 aa  219  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  25.26 
 
 
955 aa  218  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  27.33 
 
 
842 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  28.11 
 
 
841 aa  218  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>