More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7022 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  49.31 
 
 		 885 aa  775    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  52.25 
 
 		 845 aa  875    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  48.72 
 
 		 920 aa  805    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  46.59 
 
 		 889 aa  731    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  44.43 
 
 		 843 aa  701    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  45.41 
 
 		 912 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  47.51 
 
 		 837 aa  762    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 846 aa  1748    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  53.55 
 
 		 845 aa  896    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  43.56 
 
 		 1284 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  47.84 
 
 		 840 aa  809    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  47.99 
 
 		 918 aa  753    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  41.91 
 
 		 1284 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  40.05 
 
 		 952 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  40.14 
 
 		 924 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  37.96 
 
 		 941 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  37.89 
 
 		 826 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  38.29 
 
 		 975 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  37.98 
 
 		 886 aa  495  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  35.08 
 
 		 822 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  37.62 
 
 		 901 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  34.06 
 
 		 855 aa  429  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  34.71 
 
 		 890 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  31.08 
 
 		 1048 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  31.64 
 
 		 862 aa  347  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  30.13 
 
 		 862 aa  345  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  33.04 
 
 		 724 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  32.7 
 
 		 968 aa  341  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  32.37 
 
 		 834 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  32.37 
 
 		 834 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  32.37 
 
 		 834 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  34.98 
 
 		 714 aa  337  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  28.45 
 
 		 910 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  35.04 
 
 		 676 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  34.86 
 
 		 725 aa  326  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  31.15 
 
 		 865 aa  325  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  32.19 
 
 		 874 aa  325  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  32.19 
 
 		 922 aa  325  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  32.19 
 
 		 916 aa  325  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  35 
 
 		 775 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  35 
 
 		 775 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  35 
 
 		 775 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  35 
 
 		 775 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  35 
 
 		 775 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  35 
 
 		 775 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  32.51 
 
 		 1057 aa  321  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  34.82 
 
 		 775 aa  321  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  33.04 
 
 		 872 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  30 
 
 		 907 aa  308  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  33.1 
 
 		 1048 aa  307  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  33.4 
 
 		 540 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  32.86 
 
 		 896 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  32.86 
 
 		 858 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  32.86 
 
 		 930 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  29.56 
 
 		 885 aa  301  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  33.27 
 
 		 794 aa  297  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  33.15 
 
 		 743 aa  294  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  33.15 
 
 		 729 aa  293  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  33.09 
 
 		 730 aa  293  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  33.15 
 
 		 729 aa  292  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  29.06 
 
 		 871 aa  290  8e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  32.32 
 
 		 1981 aa  289  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  28.29 
 
 		 875 aa  275  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  28.02 
 
 		 869 aa  271  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  27.76 
 
 		 841 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 		 731 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 		 734 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 		 734 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 		 734 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 		 734 aa  259  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  27.76 
 
 		 841 aa  259  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 		 734 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  27.26 
 
 		 841 aa  257  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  27.31 
 
 		 838 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  32.22 
 
 		 731 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  32.42 
 
 		 734 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  33.46 
 
 		 687 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  26.87 
 
 		 853 aa  252  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  26.44 
 
 		 868 aa  251  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  29.68 
 
 		 1019 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  31.08 
 
 		 796 aa  249  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 		 1074 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  26.85 
 
 		 852 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  30.98 
 
 		 646 aa  247  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 1057 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  26.56 
 
 		 1063 aa  245  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  26.24 
 
 		 853 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  27.57 
 
 		 1057 aa  245  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  32.27 
 
 		 757 aa  243  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  27.46 
 
 		 892 aa  243  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  26.44 
 
 		 1063 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  28.74 
 
 		 1059 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  26.42 
 
 		 923 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  26.13 
 
 		 1063 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  30.25 
 
 		 643 aa  241  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  27.11 
 
 		 958 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  26.51 
 
 		 853 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  28.53 
 
 		 842 aa  239  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  27.86 
 
 		 851 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1019 aa  237  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>