More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2999 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  47.43 
 
 		 1057 aa  815    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  41.21 
 
 		 957 aa  687    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  52.08 
 
 		 730 aa  741    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  47.49 
 
 		 853 aa  779    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  46.17 
 
 		 895 aa  787    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  45.83 
 
 		 895 aa  780    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  50.3 
 
 		 852 aa  842    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  48.88 
 
 		 1063 aa  828    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  46.11 
 
 		 868 aa  746    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  45.33 
 
 		 850 aa  746    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  45.02 
 
 		 895 aa  766    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  46.89 
 
 		 853 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  48.66 
 
 		 1063 aa  825    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  47.73 
 
 		 1074 aa  827    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  47.82 
 
 		 892 aa  786    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  48.14 
 
 		 923 aa  784    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  65.5 
 
 		 890 aa  1036    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 910 aa  1873    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  49 
 
 		 1059 aa  828    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  46.06 
 
 		 895 aa  784    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  52.75 
 
 		 847 aa  697    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  48.77 
 
 		 1063 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  47.09 
 
 		 853 aa  766    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  62.71 
 
 		 855 aa  1064    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  47.77 
 
 		 1057 aa  820    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  45.4 
 
 		 891 aa  751    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  42.53 
 
 		 850 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  42.53 
 
 		 850 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  42.53 
 
 		 850 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  41.18 
 
 		 843 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  40.9 
 
 		 843 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  41.32 
 
 		 869 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  40.64 
 
 		 871 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  40.59 
 
 		 875 aa  571  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  35.83 
 
 		 958 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  37.87 
 
 		 835 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  34.33 
 
 		 912 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  35.52 
 
 		 901 aa  505  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  36.75 
 
 		 886 aa  475  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  36.96 
 
 		 975 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  34 
 
 		 912 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  35.21 
 
 		 928 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  32.6 
 
 		 961 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  35.55 
 
 		 968 aa  439  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4173  type VI secretion system Vgr family protein  35.35 
 
 		 784 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  36.98 
 
 		 826 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  32.86 
 
 		 843 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  34.7 
 
 		 780 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  33.45 
 
 		 834 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  34.16 
 
 		 822 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  34.56 
 
 		 780 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 834 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  33.45 
 
 		 834 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  32.62 
 
 		 845 aa  389  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  32.62 
 
 		 885 aa  382  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  32.08 
 
 		 845 aa  382  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  32.07 
 
 		 865 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  31.58 
 
 		 851 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  31.79 
 
 		 907 aa  362  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  30.94 
 
 		 853 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  30.69 
 
 		 889 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  28.45 
 
 		 846 aa  337  7.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  35.95 
 
 		 618 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  30.95 
 
 		 906 aa  331  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  30.83 
 
 		 906 aa  329  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  37.04 
 
 		 661 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  36.86 
 
 		 661 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  36.86 
 
 		 661 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  36.86 
 
 		 661 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  36.86 
 
 		 661 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  37.08 
 
 		 661 aa  326  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  36.86 
 
 		 661 aa  326  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  28.57 
 
 		 840 aa  323  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  28.9 
 
 		 955 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  33.11 
 
 		 661 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  28.56 
 
 		 956 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  28.56 
 
 		 956 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  27.99 
 
 		 885 aa  320  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  28.76 
 
 		 837 aa  319  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  35.28 
 
 		 616 aa  318  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  27.59 
 
 		 920 aa  318  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  34.55 
 
 		 614 aa  317  9e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  33.99 
 
 		 613 aa  317  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  36.95 
 
 		 703 aa  313  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  28.52 
 
 		 918 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  33.99 
 
 		 618 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  29.65 
 
 		 918 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  31.81 
 
 		 1019 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 1284 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1019 aa  300  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  30.02 
 
 		 898 aa  297  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  29.67 
 
 		 1048 aa  297  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  28.64 
 
 		 1284 aa  296  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  28.39 
 
 		 911 aa  296  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  28.24 
 
 		 933 aa  292  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  30.12 
 
 		 842 aa  291  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  28.04 
 
 		 862 aa  278  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  28.9 
 
 		 841 aa  277  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  27.82 
 
 		 862 aa  276  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  28.9 
 
 		 841 aa  276  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>