More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2744 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  77.65 
 
 		 853 aa  1364    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 851 aa  1745    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  54.62 
 
 		 618 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  41.49 
 
 		 906 aa  585  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  41.49 
 
 		 906 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  53.44 
 
 		 614 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  52.94 
 
 		 613 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  52.18 
 
 		 618 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  52.4 
 
 		 616 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  36.66 
 
 		 871 aa  482  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  36.29 
 
 		 926 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  36.29 
 
 		 926 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  36.42 
 
 		 875 aa  477  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  36.21 
 
 		 926 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  36.77 
 
 		 869 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  35.98 
 
 		 928 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  35.98 
 
 		 928 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  35.93 
 
 		 921 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  46.63 
 
 		 661 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  45.83 
 
 		 661 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  46.03 
 
 		 661 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  46.03 
 
 		 661 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  46.03 
 
 		 661 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  46.03 
 
 		 661 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  46.03 
 
 		 661 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  46.03 
 
 		 661 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  34.03 
 
 		 902 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  44.85 
 
 		 703 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  35.87 
 
 		 927 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  32.34 
 
 		 958 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  32.42 
 
 		 923 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  34.08 
 
 		 922 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  33.53 
 
 		 922 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  33.57 
 
 		 853 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  33.05 
 
 		 853 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  32.98 
 
 		 975 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  31.94 
 
 		 852 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  32.53 
 
 		 901 aa  382  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  32.12 
 
 		 895 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  32.62 
 
 		 850 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  32.03 
 
 		 911 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  32.5 
 
 		 886 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  31.53 
 
 		 1074 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  31.48 
 
 		 1059 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  31.6 
 
 		 1057 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  31.91 
 
 		 868 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  31.57 
 
 		 895 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  31.28 
 
 		 1063 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  31.4 
 
 		 1063 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  31.48 
 
 		 1057 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  31.28 
 
 		 1063 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  31.68 
 
 		 895 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  31.68 
 
 		 895 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  32.46 
 
 		 850 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1582  Rhs element Vgr protein  35.23 
 
 		 858 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.371781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  31.58 
 
 		 910 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  31.57 
 
 		 891 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  31.94 
 
 		 853 aa  369  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  31.99 
 
 		 892 aa  369  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  32.46 
 
 		 850 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  32.46 
 
 		 850 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  32.15 
 
 		 855 aa  360  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  30.81 
 
 		 1019 aa  354  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  32.36 
 
 		 979 aa  352  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  31.29 
 
 		 933 aa  348  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1019 aa  347  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  31.08 
 
 		 956 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  31.08 
 
 		 956 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  32.38 
 
 		 928 aa  342  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  29.93 
 
 		 955 aa  340  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  31.16 
 
 		 842 aa  340  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  36.44 
 
 		 683 aa  336  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  31.21 
 
 		 843 aa  335  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  31.82 
 
 		 898 aa  332  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  36.44 
 
 		 683 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  31.48 
 
 		 918 aa  330  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  30.34 
 
 		 843 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  29.43 
 
 		 1048 aa  329  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  28.7 
 
 		 1094 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  31.42 
 
 		 834 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  31.42 
 
 		 834 aa  326  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  31.42 
 
 		 834 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  29.52 
 
 		 957 aa  324  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  34.21 
 
 		 847 aa  324  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  31.91 
 
 		 730 aa  323  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  29.86 
 
 		 968 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  30.11 
 
 		 838 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  29.87 
 
 		 862 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  31.52 
 
 		 890 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  38.58 
 
 		 509 aa  321  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  29.87 
 
 		 841 aa  318  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  29.89 
 
 		 841 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  29.75 
 
 		 841 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  28.96 
 
 		 862 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  35.76 
 
 		 796 aa  310  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  35.04 
 
 		 646 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  34.19 
 
 		 741 aa  308  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  36.04 
 
 		 777 aa  308  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  34.39 
 
 		 741 aa  307  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  34.84 
 
 		 643 aa  307  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>