More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0127 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 928 aa  1886    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  49 
 
 		 956 aa  748    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  99.03 
 
 		 928 aa  1871    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  98.17 
 
 		 921 aa  1833    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1582  Rhs element Vgr protein  98.01 
 
 		 858 aa  1583    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.371781  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  63.79 
 
 		 922 aa  1150    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  98.81 
 
 		 926 aa  1847    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  53.52 
 
 		 902 aa  923    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  94.4 
 
 		 926 aa  1750    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  48.14 
 
 		 955 aa  734    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  94.4 
 
 		 926 aa  1750    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  49 
 
 		 956 aa  748    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  63.75 
 
 		 927 aa  1155    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  63.36 
 
 		 922 aa  1128    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  41.62 
 
 		 908 aa  609  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  42.66 
 
 		 906 aa  596  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  42.55 
 
 		 906 aa  592  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  36.04 
 
 		 853 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  35.98 
 
 		 851 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  45.7 
 
 		 509 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1019 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3222  putative VGR-related protein  45.55 
 
 		 547 aa  305  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000721759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  30.12 
 
 		 871 aa  293  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  29.23 
 
 		 842 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  37.77 
 
 		 1019 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  29.36 
 
 		 869 aa  281  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  29.6 
 
 		 875 aa  280  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  27.52 
 
 		 958 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  29.07 
 
 		 1059 aa  266  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  28.08 
 
 		 1057 aa  264  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  27.94 
 
 		 1063 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  27.94 
 
 		 1063 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 1074 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  28.08 
 
 		 1057 aa  260  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  28.51 
 
 		 923 aa  260  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  27.94 
 
 		 1063 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  28.12 
 
 		 895 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  27.93 
 
 		 895 aa  254  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  27.37 
 
 		 1048 aa  252  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  27.84 
 
 		 895 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  29.08 
 
 		 968 aa  250  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  26.69 
 
 		 892 aa  250  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  28.2 
 
 		 853 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  26.88 
 
 		 862 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  28.96 
 
 		 855 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  28.75 
 
 		 853 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  28.12 
 
 		 910 aa  243  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  28.87 
 
 		 853 aa  242  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  27.37 
 
 		 895 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  28.28 
 
 		 852 aa  239  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  29.33 
 
 		 850 aa  238  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  26.76 
 
 		 862 aa  238  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  29.33 
 
 		 850 aa  238  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  28.19 
 
 		 850 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  29.16 
 
 		 850 aa  237  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  27.92 
 
 		 891 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  26.54 
 
 		 886 aa  232  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 979 aa  230  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  26.79 
 
 		 901 aa  230  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  27.26 
 
 		 911 aa  230  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  26.09 
 
 		 933 aa  224  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  27.23 
 
 		 868 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  29.21 
 
 		 822 aa  224  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  26.64 
 
 		 975 aa  224  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  28.14 
 
 		 928 aa  212  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  29.46 
 
 		 840 aa  211  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  28.59 
 
 		 890 aa  210  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  27.26 
 
 		 895 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  27.57 
 
 		 898 aa  208  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  28.22 
 
 		 730 aa  208  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  25.85 
 
 		 1284 aa  209  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  27.52 
 
 		 885 aa  207  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  26.38 
 
 		 1111 aa  205  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1111 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  26.6 
 
 		 1111 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  27.09 
 
 		 1284 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  28.5 
 
 		 847 aa  199  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  25.62 
 
 		 1111 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  27.58 
 
 		 847 aa  197  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  26.75 
 
 		 920 aa  197  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  27.25 
 
 		 837 aa  196  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  26.57 
 
 		 957 aa  195  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  26.81 
 
 		 1094 aa  195  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  26.59 
 
 		 918 aa  195  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  26.79 
 
 		 845 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  29.8 
 
 		 920 aa  191  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  29.64 
 
 		 920 aa  191  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  26.25 
 
 		 845 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  28.15 
 
 		 918 aa  189  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  27.12 
 
 		 843 aa  189  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  28.04 
 
 		 947 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  28.54 
 
 		 927 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  25.88 
 
 		 843 aa  180  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  29.72 
 
 		 849 aa  179  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  25.12 
 
 		 941 aa  178  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  25.39 
 
 		 1114 aa  178  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  27.01 
 
 		 843 aa  177  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  27.25 
 
 		 889 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  25.64 
 
 		 846 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  26.3 
 
 		 835 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>