More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2206 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  64.99 
 
 		 946 aa  1164    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  64.88 
 
 		 946 aa  1161    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  64.88 
 
 		 946 aa  1164    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  45.93 
 
 		 920 aa  704    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 927 aa  1867    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  61.96 
 
 		 947 aa  1118    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  46.15 
 
 		 920 aa  704    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  66.38 
 
 		 942 aa  1221    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  45.61 
 
 		 849 aa  629  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  39.09 
 
 		 933 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  39.59 
 
 		 918 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  44.2 
 
 		 892 aa  506  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  30.88 
 
 		 911 aa  312  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  29.6 
 
 		 871 aa  300  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  29.08 
 
 		 869 aa  289  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  29.03 
 
 		 875 aa  286  8e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  30.35 
 
 		 1094 aa  267  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  27.84 
 
 		 850 aa  262  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  28.37 
 
 		 895 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  27.83 
 
 		 1057 aa  261  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  26.26 
 
 		 958 aa  260  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 		 853 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  28.3 
 
 		 935 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1111 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  27.73 
 
 		 1074 aa  252  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  28.31 
 
 		 1111 aa  252  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  28.09 
 
 		 1059 aa  250  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  28.09 
 
 		 1111 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  27.75 
 
 		 1057 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  29.03 
 
 		 847 aa  246  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  28.19 
 
 		 935 aa  245  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  26.66 
 
 		 1063 aa  245  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1606  Rhs element Vgr protein  28.19 
 
 		 935 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  27.17 
 
 		 851 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0498  Rhs element Vgr protein  28.19 
 
 		 935 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  28.19 
 
 		 935 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  27.16 
 
 		 1063 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 1063 aa  245  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  28.19 
 
 		 935 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  26.52 
 
 		 957 aa  242  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1580  Rhs element Vgr protein  28.19 
 
 		 935 aa  243  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  27.75 
 
 		 1114 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  27.98 
 
 		 1111 aa  240  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  26.83 
 
 		 895 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  26.72 
 
 		 895 aa  237  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  27.63 
 
 		 932 aa  237  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  27.23 
 
 		 895 aa  237  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  27.56 
 
 		 895 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  27.94 
 
 		 979 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  28.48 
 
 		 1006 aa  234  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  28.81 
 
 		 962 aa  233  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  28.32 
 
 		 898 aa  233  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  28.21 
 
 		 984 aa  231  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 853 aa  230  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  28.38 
 
 		 928 aa  231  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  26.94 
 
 		 853 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  27.45 
 
 		 852 aa  228  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  26.86 
 
 		 891 aa  228  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  27.41 
 
 		 853 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  28.52 
 
 		 730 aa  221  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  25 
 
 		 868 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  26.28 
 
 		 892 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  25.63 
 
 		 923 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  28.15 
 
 		 975 aa  208  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  27.15 
 
 		 850 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 850 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 850 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  28.54 
 
 		 981 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  25.22 
 
 		 910 aa  205  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  27.05 
 
 		 901 aa  202  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  27.51 
 
 		 886 aa  201  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  27.74 
 
 		 906 aa  195  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  27.27 
 
 		 906 aa  193  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  25.56 
 
 		 855 aa  190  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  24.51 
 
 		 955 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  26.93 
 
 		 843 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  24.81 
 
 		 956 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  24.81 
 
 		 956 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  27.28 
 
 		 922 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  28.07 
 
 		 811 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  28.43 
 
 		 928 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  28.21 
 
 		 926 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  27.9 
 
 		 921 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  28.54 
 
 		 928 aa  181  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  29.15 
 
 		 741 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  25.19 
 
 		 890 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  25.53 
 
 		 902 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  30.01 
 
 		 612 aa  179  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  25.53 
 
 		 843 aa  179  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  26.24 
 
 		 841 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  29.13 
 
 		 689 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  26.83 
 
 		 847 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  26.22 
 
 		 683 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  26.3 
 
 		 614 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  28.94 
 
 		 689 aa  172  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  28.04 
 
 		 684 aa  172  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  27.89 
 
 		 661 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  25.71 
 
 		 683 aa  172  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  27.81 
 
 		 661 aa  172  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  27.71 
 
 		 661 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>