More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4520 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  58.43 
 
 		 922 aa  1006    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  44.74 
 
 		 955 aa  749    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  63.65 
 
 		 926 aa  1183    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  63.54 
 
 		 921 aa  1180    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1582  Rhs element Vgr protein  66.5 
 
 		 858 aa  1079    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.371781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  63.75 
 
 		 928 aa  1183    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 927 aa  1892    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  52.3 
 
 		 902 aa  917    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  64.19 
 
 		 926 aa  1199    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  45.31 
 
 		 956 aa  750    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  64.19 
 
 		 926 aa  1199    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  63.75 
 
 		 928 aa  1185    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  45.31 
 
 		 956 aa  750    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  57.97 
 
 		 922 aa  978    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  39.96 
 
 		 908 aa  612  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  39.52 
 
 		 906 aa  533  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  39.41 
 
 		 906 aa  528  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  35.39 
 
 		 853 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  36.02 
 
 		 851 aa  459  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  47.46 
 
 		 509 aa  395  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  38.08 
 
 		 1019 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  38.2 
 
 		 1019 aa  300  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3222  putative VGR-related protein  40.31 
 
 		 547 aa  287  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000721759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  29.89 
 
 		 869 aa  280  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  29.64 
 
 		 871 aa  275  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  27.8 
 
 		 862 aa  274  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  27.03 
 
 		 958 aa  273  9e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  36.23 
 
 		 842 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  28.44 
 
 		 1048 aa  273  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  29.52 
 
 		 875 aa  270  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  27.56 
 
 		 862 aa  267  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  28.9 
 
 		 822 aa  252  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  27.77 
 
 		 1057 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  27.8 
 
 		 1059 aa  252  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  27.66 
 
 		 911 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 		 1057 aa  247  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  28.17 
 
 		 1063 aa  245  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  28.17 
 
 		 1063 aa  245  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  27.57 
 
 		 1074 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  27.9 
 
 		 1063 aa  244  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  27.57 
 
 		 895 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  27.88 
 
 		 895 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  27.68 
 
 		 895 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  26.95 
 
 		 892 aa  243  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  25.75 
 
 		 886 aa  241  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  27.51 
 
 		 968 aa  238  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  26.74 
 
 		 891 aa  238  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  26.93 
 
 		 895 aa  237  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  26.81 
 
 		 979 aa  236  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  26.54 
 
 		 975 aa  235  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  28.5 
 
 		 855 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  27 
 
 		 901 aa  233  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  27.66 
 
 		 850 aa  228  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  27.78 
 
 		 850 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  27.78 
 
 		 850 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  26.97 
 
 		 928 aa  223  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  26.89 
 
 		 895 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  28.19 
 
 		 853 aa  222  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  26.2 
 
 		 923 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  27.35 
 
 		 850 aa  221  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  27.06 
 
 		 853 aa  221  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  27.15 
 
 		 853 aa  218  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 843 aa  213  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  26.7 
 
 		 898 aa  213  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  25.2 
 
 		 868 aa  213  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  26.83 
 
 		 910 aa  211  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 933 aa  207  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1111 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  26.54 
 
 		 1111 aa  207  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  26.26 
 
 		 1111 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  26.54 
 
 		 1111 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  26.81 
 
 		 845 aa  204  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  26.39 
 
 		 852 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  27.79 
 
 		 918 aa  200  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  27.48 
 
 		 845 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  27.2 
 
 		 920 aa  196  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  26.95 
 
 		 890 aa  196  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  25.6 
 
 		 1094 aa  194  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 920 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  27.32 
 
 		 840 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  27.03 
 
 		 847 aa  189  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  26.78 
 
 		 957 aa  189  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  27.19 
 
 		 849 aa  188  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  28.35 
 
 		 730 aa  188  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  26.16 
 
 		 1284 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  27.04 
 
 		 947 aa  180  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  25.44 
 
 		 1284 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  25.93 
 
 		 941 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  25.75 
 
 		 885 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  24.7 
 
 		 1114 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  26.57 
 
 		 1006 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  24.97 
 
 		 826 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  25.24 
 
 		 837 aa  171  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  27.53 
 
 		 847 aa  171  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  24.79 
 
 		 920 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  26.53 
 
 		 962 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  25.79 
 
 		 843 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  24.88 
 
 		 834 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  24.88 
 
 		 834 aa  164  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  24.88 
 
 		 834 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>