More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2209 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  72.96 
 
 		 1111 aa  1265    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  46.21 
 
 		 847 aa  674    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  41.52 
 
 		 911 aa  677    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  73.19 
 
 		 1111 aa  1271    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  73.42 
 
 		 1111 aa  1274    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  71.41 
 
 		 1114 aa  1247    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 895 aa  1819    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  73.76 
 
 		 1111 aa  1277    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  38.29 
 
 		 898 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  44.37 
 
 		 612 aa  489  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02036  Rhs element Vgr protein  46.43 
 
 		 587 aa  475  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372394  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  48.72 
 
 		 477 aa  425  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  27.89 
 
 		 871 aa  291  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  30.18 
 
 		 918 aa  282  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  27.94 
 
 		 875 aa  282  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  27.07 
 
 		 958 aa  278  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  26.45 
 
 		 933 aa  275  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  28.54 
 
 		 853 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  27.24 
 
 		 869 aa  274  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  29.3 
 
 		 920 aa  272  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  28.79 
 
 		 920 aa  270  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  26.63 
 
 		 923 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  28.26 
 
 		 927 aa  258  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  27.44 
 
 		 850 aa  257  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  27.44 
 
 		 850 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  26.42 
 
 		 1063 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  26.42 
 
 		 1063 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  27.44 
 
 		 850 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  26.36 
 
 		 1063 aa  254  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  26.47 
 
 		 892 aa  253  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  29.58 
 
 		 849 aa  250  8e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  25.26 
 
 		 850 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  28.12 
 
 		 851 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  25.25 
 
 		 853 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  28.89 
 
 		 947 aa  241  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  27.25 
 
 		 906 aa  241  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  25.2 
 
 		 868 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  27.18 
 
 		 906 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  24.89 
 
 		 853 aa  238  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  27.71 
 
 		 1284 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1019 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  24.35 
 
 		 853 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  26.15 
 
 		 886 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  26.23 
 
 		 968 aa  226  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  25.93 
 
 		 1094 aa  225  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  26.65 
 
 		 979 aa  225  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  26.01 
 
 		 957 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  25.3 
 
 		 891 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1019 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  28.43 
 
 		 942 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  26.22 
 
 		 843 aa  217  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  24.86 
 
 		 895 aa  217  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  25.95 
 
 		 981 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  26.15 
 
 		 1006 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  26.27 
 
 		 842 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  26.12 
 
 		 885 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  27.82 
 
 		 946 aa  212  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  24.38 
 
 		 895 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  27.82 
 
 		 946 aa  211  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  28.83 
 
 		 1074 aa  211  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  26.45 
 
 		 1284 aa  211  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  24.32 
 
 		 895 aa  210  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  24.27 
 
 		 895 aa  209  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  27.4 
 
 		 926 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  27.26 
 
 		 928 aa  209  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  27.71 
 
 		 946 aa  208  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  27.13 
 
 		 927 aa  208  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  27.6 
 
 		 928 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  25.72 
 
 		 901 aa  207  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  25.23 
 
 		 852 aa  207  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  26.9 
 
 		 926 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  26.9 
 
 		 926 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  27.35 
 
 		 921 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  30.26 
 
 		 1057 aa  205  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  25.61 
 
 		 920 aa  205  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  26.56 
 
 		 928 aa  204  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  25.53 
 
 		 845 aa  204  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  25.53 
 
 		 822 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  25.37 
 
 		 984 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1779  hypothetical protein  85.45 
 
 		 110 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0350078  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  29.68 
 
 		 1057 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  25.68 
 
 		 935 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  25.95 
 
 		 932 aa  199  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  25.09 
 
 		 838 aa  198  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  25.53 
 
 		 962 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  24.91 
 
 		 975 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1580  Rhs element Vgr protein  25.79 
 
 		 935 aa  194  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  24.8 
 
 		 855 aa  194  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  29.17 
 
 		 1059 aa  193  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  25.79 
 
 		 935 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0498  Rhs element Vgr protein  25.79 
 
 		 935 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  25.79 
 
 		 935 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  25.47 
 
 		 843 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1606  Rhs element Vgr protein  25.79 
 
 		 935 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  29.09 
 
 		 661 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  25.16 
 
 		 902 aa  191  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  24.97 
 
 		 730 aa  191  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  25.68 
 
 		 935 aa  190  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  28.71 
 
 		 661 aa  190  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  28.52 
 
 		 661 aa  189  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>