More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7615 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0498  Rhs element Vgr protein  73.43 
 
 
935 aa  1343    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  66.4 
 
 
981 aa  1313    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  73.21 
 
 
935 aa  1337    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  73.1 
 
 
935 aa  1357    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1606  Rhs element Vgr protein  73.43 
 
 
935 aa  1343    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
984 aa  1984    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1580  Rhs element Vgr protein  73.32 
 
 
935 aa  1344    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  72.77 
 
 
932 aa  1333    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  45.03 
 
 
928 aa  663    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  73.43 
 
 
935 aa  1343    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  44.2 
 
 
979 aa  673    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  73.43 
 
 
935 aa  1343    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  40.79 
 
 
1094 aa  611  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  38.23 
 
 
1006 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  38.44 
 
 
962 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  40.43 
 
 
811 aa  481  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04713  Rhs element Vgr protein  41.23 
 
 
564 aa  291  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  29.66 
 
 
871 aa  281  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  28.11 
 
 
911 aa  280  9e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  29.18 
 
 
875 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  28.52 
 
 
869 aa  272  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04712  Rhs element Vgr protein  48.35 
 
 
336 aa  269  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  28.51 
 
 
933 aa  262  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  27.71 
 
 
958 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  28.7 
 
 
853 aa  250  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  26.46 
 
 
895 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  26.14 
 
 
895 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  26.14 
 
 
895 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  26.21 
 
 
895 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  28.15 
 
 
851 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  26.13 
 
 
891 aa  230  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  28.87 
 
 
918 aa  229  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  27.33 
 
 
927 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  27.47 
 
 
947 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  25.19 
 
 
850 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  25 
 
 
1057 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  24.73 
 
 
1074 aa  215  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  29.58 
 
 
920 aa  215  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  24.97 
 
 
923 aa  213  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  24.39 
 
 
1063 aa  212  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  29.86 
 
 
920 aa  212  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  24.36 
 
 
1063 aa  212  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  24.36 
 
 
1063 aa  212  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  24.39 
 
 
1057 aa  210  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  28.74 
 
 
906 aa  210  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  24.28 
 
 
1059 aa  209  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  28.53 
 
 
906 aa  205  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  26.95 
 
 
942 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  25.3 
 
 
850 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  25.19 
 
 
850 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  25.3 
 
 
850 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  25.37 
 
 
895 aa  199  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  27.42 
 
 
847 aa  198  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  24.62 
 
 
868 aa  195  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  30.27 
 
 
616 aa  195  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  24.34 
 
 
892 aa  193  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  27.5 
 
 
946 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  27.39 
 
 
946 aa  192  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  27.5 
 
 
946 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  23.97 
 
 
853 aa  191  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  24.44 
 
 
853 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  26.6 
 
 
843 aa  189  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  28.87 
 
 
849 aa  185  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  24.45 
 
 
852 aa  183  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  26.7 
 
 
1114 aa  183  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  25.77 
 
 
1111 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  25.74 
 
 
898 aa  181  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  26.43 
 
 
843 aa  180  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  24.14 
 
 
853 aa  179  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  25.66 
 
 
1111 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  24.44 
 
 
957 aa  176  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  23.87 
 
 
968 aa  174  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  28.38 
 
 
661 aa  172  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  28.38 
 
 
661 aa  172  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  28.38 
 
 
661 aa  172  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  28.38 
 
 
661 aa  172  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  25.25 
 
 
1111 aa  171  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  28.38 
 
 
661 aa  171  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  28.38 
 
 
661 aa  171  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  25.05 
 
 
1111 aa  171  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  28.18 
 
 
661 aa  170  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  28.51 
 
 
661 aa  168  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  25.33 
 
 
910 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  28.85 
 
 
618 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  25.5 
 
 
975 aa  164  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  24.83 
 
 
730 aa  163  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  28.65 
 
 
613 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  25.52 
 
 
886 aa  161  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  27.81 
 
 
614 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  25.14 
 
 
855 aa  160  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  28.54 
 
 
618 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  30.87 
 
 
892 aa  157  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  24.94 
 
 
901 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  27.58 
 
 
703 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  24.56 
 
 
902 aa  151  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  25.21 
 
 
683 aa  149  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  25.18 
 
 
908 aa  146  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  23.81 
 
 
961 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  26.64 
 
 
890 aa  145  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  29.59 
 
 
694 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>