More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02040 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  46.09 
 
 		 895 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  72.77 
 
 		 612 aa  850    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  95.19 
 
 		 477 aa  884    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  45.08 
 
 		 911 aa  691    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  47.98 
 
 		 1111 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  47.98 
 
 		 1111 aa  691    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  48.1 
 
 		 1111 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  45.84 
 
 		 1114 aa  668    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 847 aa  1674    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  48.53 
 
 		 1111 aa  704    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02036  Rhs element Vgr protein  98.8 
 
 		 587 aa  1126    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372394  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  43.01 
 
 		 898 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  32.34 
 
 		 875 aa  364  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  32.16 
 
 		 869 aa  363  9e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  32.31 
 
 		 871 aa  361  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  32.67 
 
 		 918 aa  334  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  31.76 
 
 		 933 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  29.9 
 
 		 958 aa  324  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  30.27 
 
 		 851 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  32.83 
 
 		 920 aa  303  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  32.22 
 
 		 920 aa  301  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  29.08 
 
 		 1057 aa  296  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  28.99 
 
 		 1059 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  30.11 
 
 		 853 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  28.84 
 
 		 1063 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  28.84 
 
 		 1063 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  28.61 
 
 		 1057 aa  293  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  28.64 
 
 		 1074 aa  292  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  28.52 
 
 		 1063 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  30.46 
 
 		 1094 aa  291  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  28.38 
 
 		 923 aa  288  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  29.96 
 
 		 979 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  27.96 
 
 		 850 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  29.27 
 
 		 895 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  30.29 
 
 		 928 aa  281  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  28.62 
 
 		 850 aa  278  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  28.92 
 
 		 895 aa  277  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  32.58 
 
 		 849 aa  277  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  28.55 
 
 		 891 aa  277  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  28.55 
 
 		 895 aa  277  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  28.5 
 
 		 850 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  28.5 
 
 		 850 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  28.81 
 
 		 895 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  28.05 
 
 		 892 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  27.35 
 
 		 853 aa  270  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  26.2 
 
 		 852 aa  266  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  26.74 
 
 		 853 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  27.55 
 
 		 853 aa  261  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  26.6 
 
 		 868 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  27.83 
 
 		 843 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  29.32 
 
 		 927 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  27.69 
 
 		 968 aa  240  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  29.07 
 
 		 842 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1019 aa  237  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  27.41 
 
 		 843 aa  234  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  27.66 
 
 		 957 aa  233  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  29.61 
 
 		 947 aa  232  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  27.24 
 
 		 910 aa  232  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1019 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  29.74 
 
 		 942 aa  231  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  27.83 
 
 		 730 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04256  hypothetical protein  64.53 
 
 		 328 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  25.49 
 
 		 855 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  28.12 
 
 		 981 aa  218  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  26.84 
 
 		 886 aa  217  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  32.18 
 
 		 748 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  26.09 
 
 		 838 aa  213  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  26.75 
 
 		 920 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  25.86 
 
 		 901 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  26.02 
 
 		 961 aa  208  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  26.51 
 
 		 846 aa  207  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  26.1 
 
 		 975 aa  204  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  27.17 
 
 		 984 aa  201  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  26.25 
 
 		 847 aa  201  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  25.65 
 
 		 835 aa  201  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  25.51 
 
 		 902 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  28.08 
 
 		 885 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  27.94 
 
 		 613 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  27.34 
 
 		 834 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  28.23 
 
 		 837 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  27.34 
 
 		 834 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  26.72 
 
 		 845 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  27.34 
 
 		 834 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  28.17 
 
 		 928 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  28.24 
 
 		 618 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  28.25 
 
 		 928 aa  197  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  27.3 
 
 		 935 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  27.31 
 
 		 618 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  26.21 
 
 		 890 aa  195  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  26.4 
 
 		 845 aa  195  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  27.93 
 
 		 811 aa  194  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  28.79 
 
 		 926 aa  194  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  28.49 
 
 		 926 aa  194  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  30.71 
 
 		 892 aa  194  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  28.49 
 
 		 926 aa  194  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  28.11 
 
 		 918 aa  194  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  27.53 
 
 		 661 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  27.36 
 
 		 661 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  28.84 
 
 		 921 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  30.44 
 
 		 946 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>