More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0023 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  57.25 
 
 		 840 aa  942    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  94.92 
 
 		 837 aa  1634    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  45.45 
 
 		 952 aa  753    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 885 aa  1831    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  49.31 
 
 		 846 aa  774    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  47.13 
 
 		 924 aa  763    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  43.41 
 
 		 845 aa  666    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  48.69 
 
 		 912 aa  778    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  82.74 
 
 		 920 aa  1487    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  69.72 
 
 		 889 aa  1198    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  91.94 
 
 		 918 aa  1653    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  45.52 
 
 		 845 aa  695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  43.5 
 
 		 1284 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  42.35 
 
 		 1284 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  42.79 
 
 		 843 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  36.18 
 
 		 941 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  38.43 
 
 		 826 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  36.17 
 
 		 822 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  34.53 
 
 		 975 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  34.27 
 
 		 886 aa  429  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  32.43 
 
 		 1048 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  34.07 
 
 		 901 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  31.46 
 
 		 862 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  33.37 
 
 		 855 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  31.63 
 
 		 862 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  32.14 
 
 		 890 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  37.99 
 
 		 724 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  38.21 
 
 		 775 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  38.21 
 
 		 775 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  38.21 
 
 		 775 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  38.21 
 
 		 775 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  38.21 
 
 		 775 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  38.21 
 
 		 775 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  38.04 
 
 		 775 aa  361  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  38.53 
 
 		 676 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  37.25 
 
 		 725 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  34.78 
 
 		 922 aa  357  6.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  34.78 
 
 		 916 aa  357  6.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  34.78 
 
 		 874 aa  357  6.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  36.17 
 
 		 714 aa  347  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  30.41 
 
 		 968 aa  341  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  36.1 
 
 		 1981 aa  340  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  34.27 
 
 		 1057 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  36.48 
 
 		 540 aa  336  9e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  36.94 
 
 		 729 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  36.57 
 
 		 729 aa  331  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  35.16 
 
 		 872 aa  330  7e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  36.23 
 
 		 743 aa  330  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  34.98 
 
 		 930 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  34.98 
 
 		 858 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  34.98 
 
 		 896 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  31.16 
 
 		 871 aa  324  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  35.56 
 
 		 730 aa  324  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  29.04 
 
 		 852 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  27.99 
 
 		 910 aa  320  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  34.39 
 
 		 1048 aa  317  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  34.34 
 
 		 794 aa  316  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  28.83 
 
 		 869 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  30.01 
 
 		 843 aa  307  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  28.65 
 
 		 875 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  36.43 
 
 		 731 aa  304  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  36.24 
 
 		 734 aa  302  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  36.24 
 
 		 734 aa  302  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  36.24 
 
 		 731 aa  302  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  36.24 
 
 		 734 aa  302  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  36.24 
 
 		 734 aa  302  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  36.24 
 
 		 734 aa  302  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  31.1 
 
 		 834 aa  300  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  31.1 
 
 		 834 aa  300  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  31.1 
 
 		 834 aa  300  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  36.05 
 
 		 734 aa  299  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  36.12 
 
 		 757 aa  296  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  29.85 
 
 		 853 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  28.94 
 
 		 1063 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  28.9 
 
 		 923 aa  292  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  28.94 
 
 		 1063 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  28.25 
 
 		 843 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  27.64 
 
 		 1074 aa  290  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  27.99 
 
 		 838 aa  290  9e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  35.36 
 
 		 734 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  28.71 
 
 		 1063 aa  288  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  35.17 
 
 		 734 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  28.13 
 
 		 895 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  28.02 
 
 		 1057 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  27.58 
 
 		 895 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  27.69 
 
 		 895 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  27.99 
 
 		 1057 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  28.12 
 
 		 1059 aa  283  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  27.69 
 
 		 895 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  27.93 
 
 		 891 aa  282  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1019 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  28.77 
 
 		 842 aa  279  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1019 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 841 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  31.97 
 
 		 841 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 841 aa  276  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  28.28 
 
 		 853 aa  275  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  27.04 
 
 		 868 aa  275  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  29.38 
 
 		 853 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  29.55 
 
 		 907 aa  270  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>