More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0475 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  50.6 
 
 		 843 aa  796    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  54.67 
 
 		 957 aa  915    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  67.91 
 
 		 1057 aa  1209    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  67.67 
 
 		 1063 aa  1186    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  62.21 
 
 		 895 aa  1066    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  62.47 
 
 		 895 aa  1075    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  68.64 
 
 		 1059 aa  1181    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  62.33 
 
 		 895 aa  1072    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  90.15 
 
 		 853 aa  1592    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  51.32 
 
 		 850 aa  827    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  62.69 
 
 		 850 aa  1083    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  43.56 
 
 		 928 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  62.44 
 
 		 852 aa  1065    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  67.07 
 
 		 1074 aa  1170    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  83.13 
 
 		 892 aa  1439    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  75.45 
 
 		 923 aa  1319    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  45.17 
 
 		 890 aa  710    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  49.7 
 
 		 843 aa  775    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  68.03 
 
 		 1063 aa  1187    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  47.25 
 
 		 910 aa  786    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  63.3 
 
 		 868 aa  1073    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  43.89 
 
 		 961 aa  688    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  47.98 
 
 		 780 aa  684    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  47.98 
 
 		 780 aa  684    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  85.58 
 
 		 853 aa  1510    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  67.22 
 
 		 730 aa  1007    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  51.32 
 
 		 850 aa  831    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  46.14 
 
 		 869 aa  720    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  45.94 
 
 		 875 aa  711    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  46.35 
 
 		 871 aa  719    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  62.09 
 
 		 895 aa  1063    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  99.85 
 
 		 847 aa  1378    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  67.55 
 
 		 1063 aa  1184    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  51.32 
 
 		 850 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  45.2 
 
 		 855 aa  754    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  67.79 
 
 		 1057 aa  1184    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  44.63 
 
 		 835 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  62.73 
 
 		 891 aa  1069    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 853 aa  1767    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  40.61 
 
 		 958 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4173  type VI secretion system Vgr family protein  46.83 
 
 		 784 aa  621  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  41.83 
 
 		 912 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  33.41 
 
 		 851 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  32.81 
 
 		 853 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  29.27 
 
 		 898 aa  335  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  30.16 
 
 		 933 aa  335  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  29.45 
 
 		 911 aa  335  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  30.4 
 
 		 918 aa  334  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  30.35 
 
 		 886 aa  333  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  30.52 
 
 		 975 aa  330  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  30.49 
 
 		 901 aa  328  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  31.1 
 
 		 906 aa  317  7e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  30.78 
 
 		 906 aa  312  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  29.33 
 
 		 968 aa  310  8e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  29.07 
 
 		 1094 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  29.38 
 
 		 834 aa  300  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  29.38 
 
 		 834 aa  300  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  29.27 
 
 		 834 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  34.21 
 
 		 616 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  33.27 
 
 		 613 aa  293  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  34.73 
 
 		 618 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  29.62 
 
 		 1019 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1019 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  29.43 
 
 		 822 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  33.84 
 
 		 661 aa  288  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  29.44 
 
 		 842 aa  288  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  33.65 
 
 		 661 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  33.65 
 
 		 661 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  33.65 
 
 		 661 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  33.84 
 
 		 661 aa  287  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  33.65 
 
 		 661 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  33.65 
 
 		 661 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  33.02 
 
 		 618 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  26.39 
 
 		 845 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  29.02 
 
 		 837 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  27.62 
 
 		 843 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  26.83 
 
 		 845 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  28.48 
 
 		 920 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  33.52 
 
 		 661 aa  283  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  28.05 
 
 		 1284 aa  281  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  29.38 
 
 		 885 aa  279  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  27.6 
 
 		 1284 aa  278  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  27.84 
 
 		 840 aa  278  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  33.84 
 
 		 703 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  29.51 
 
 		 918 aa  275  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  32.59 
 
 		 614 aa  273  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  28.09 
 
 		 902 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  28.63 
 
 		 920 aa  270  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  29.43 
 
 		 952 aa  269  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  28.12 
 
 		 1048 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  27.24 
 
 		 928 aa  267  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  28.31 
 
 		 920 aa  266  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  27.38 
 
 		 841 aa  266  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  27.38 
 
 		 841 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  27.39 
 
 		 962 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  27.26 
 
 		 841 aa  264  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  27.11 
 
 		 847 aa  261  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  27.31 
 
 		 979 aa  259  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  27.94 
 
 		 838 aa  258  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  26.17 
 
 		 1114 aa  258  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>