More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2668 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  62.89 
 
 		 850 aa  1074    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  91.84 
 
 		 895 aa  1695    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  53.65 
 
 		 957 aa  931    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  65.42 
 
 		 1059 aa  1107    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  65.05 
 
 		 1063 aa  1108    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  43.14 
 
 		 961 aa  675    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  98.88 
 
 		 895 aa  1836    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  40.34 
 
 		 958 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  51.81 
 
 		 843 aa  816    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  51.08 
 
 		 850 aa  832    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  65.18 
 
 		 1063 aa  1108    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  51.08 
 
 		 850 aa  828    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  60.94 
 
 		 852 aa  1038    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  51.21 
 
 		 843 aa  810    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  61.66 
 
 		 1074 aa  1118    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  62.08 
 
 		 892 aa  1060    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  60.86 
 
 		 923 aa  1068    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  44.55 
 
 		 890 aa  722    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  64.93 
 
 		 1057 aa  1135    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  45.83 
 
 		 910 aa  780    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  64.99 
 
 		 730 aa  956    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  61.61 
 
 		 868 aa  1048    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  61.85 
 
 		 853 aa  1040    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  63.06 
 
 		 853 aa  1077    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  62.33 
 
 		 853 aa  1070    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  44.04 
 
 		 869 aa  682    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  44.52 
 
 		 875 aa  684    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  44.42 
 
 		 871 aa  686    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 895 aa  1852    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  98.77 
 
 		 895 aa  1833    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  59.58 
 
 		 847 aa  838    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  64.93 
 
 		 1063 aa  1106    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  51.08 
 
 		 850 aa  828    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  46.88 
 
 		 855 aa  737    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  65.18 
 
 		 1057 aa  1115    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  45.88 
 
 		 835 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  92.25 
 
 		 891 aa  1685    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  46.67 
 
 		 780 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  46.67 
 
 		 780 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  40.37 
 
 		 928 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4173  type VI secretion system Vgr family protein  43.98 
 
 		 784 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  37.84 
 
 		 912 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  32.08 
 
 		 851 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  30.35 
 
 		 911 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  31.22 
 
 		 853 aa  366  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  30.6 
 
 		 898 aa  353  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  29.6 
 
 		 918 aa  343  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  28.88 
 
 		 1094 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  30.52 
 
 		 886 aa  337  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  28.27 
 
 		 933 aa  323  8e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  30.08 
 
 		 906 aa  321  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  29.99 
 
 		 906 aa  320  7.999999999999999e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  30.41 
 
 		 975 aa  316  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  29.04 
 
 		 979 aa  313  6.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  29.13 
 
 		 928 aa  306  9.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  29.43 
 
 		 968 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  28.78 
 
 		 1048 aa  301  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  28.76 
 
 		 901 aa  300  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  27.36 
 
 		 920 aa  290  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  28.29 
 
 		 845 aa  289  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1019 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  28.21 
 
 		 842 aa  287  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  28.3 
 
 		 885 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  29.39 
 
 		 847 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1019 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  31.68 
 
 		 616 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  28.31 
 
 		 1284 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  29.31 
 
 		 845 aa  281  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  30.25 
 
 		 822 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  27.9 
 
 		 837 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  28.74 
 
 		 843 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  27.62 
 
 		 862 aa  273  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  27.7 
 
 		 1284 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  31.11 
 
 		 618 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  30.58 
 
 		 618 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  27.07 
 
 		 862 aa  267  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  27.91 
 
 		 918 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  31.17 
 
 		 613 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  26.77 
 
 		 902 aa  265  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  26.67 
 
 		 924 aa  264  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  28.16 
 
 		 920 aa  263  8e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  28.61 
 
 		 834 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  27.52 
 
 		 1006 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  31.51 
 
 		 661 aa  262  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  28.49 
 
 		 834 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  31.51 
 
 		 661 aa  262  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  27.75 
 
 		 952 aa  261  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  31.33 
 
 		 661 aa  261  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  28.05 
 
 		 920 aa  261  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  31.33 
 
 		 661 aa  261  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  31.33 
 
 		 661 aa  261  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  31.33 
 
 		 661 aa  261  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  31.33 
 
 		 661 aa  261  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  28.37 
 
 		 834 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  28.5 
 
 		 922 aa  258  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  30.92 
 
 		 661 aa  258  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  32.76 
 
 		 703 aa  257  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  27.14 
 
 		 840 aa  257  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  30.81 
 
 		 614 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  28.74 
 
 		 926 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>