More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2693 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  46.09 
 
 
849 aa  640    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  94.5 
 
 
946 aa  1668    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  66.49 
 
 
927 aa  1244    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  46.47 
 
 
920 aa  706    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  71.37 
 
 
947 aa  1310    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  94.5 
 
 
946 aa  1666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  100 
 
 
942 aa  1889    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  45.94 
 
 
920 aa  702    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  94.5 
 
 
946 aa  1667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  39.49 
 
 
933 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  39.58 
 
 
918 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  44.09 
 
 
892 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  27.87 
 
 
911 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  29.47 
 
 
871 aa  277  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  27.04 
 
 
958 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  29.33 
 
 
875 aa  272  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  28.41 
 
 
869 aa  265  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  28.76 
 
 
1094 aa  259  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  27.18 
 
 
1057 aa  258  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  27.43 
 
 
850 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  29.99 
 
 
1114 aa  251  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  29.97 
 
 
898 aa  249  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  29.16 
 
 
935 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  27.6 
 
 
1074 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  27.24 
 
 
1059 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  26.47 
 
 
851 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  28.04 
 
 
957 aa  244  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  29.43 
 
 
847 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  27.07 
 
 
1057 aa  241  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  29.87 
 
 
1111 aa  241  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  26.94 
 
 
1063 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  29.44 
 
 
1111 aa  241  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  26.83 
 
 
1063 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  26.81 
 
 
853 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0498  Rhs element Vgr protein  29.06 
 
 
935 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  29.06 
 
 
935 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  29.06 
 
 
935 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  28.54 
 
 
895 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  26.94 
 
 
1063 aa  237  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1606  Rhs element Vgr protein  28.85 
 
 
935 aa  237  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  29.06 
 
 
935 aa  237  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  27.57 
 
 
923 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  29.22 
 
 
1111 aa  235  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1580  Rhs element Vgr protein  28.95 
 
 
935 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  28.54 
 
 
979 aa  233  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  28.08 
 
 
853 aa  233  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  29.12 
 
 
928 aa  231  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  27.47 
 
 
853 aa  230  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  28.96 
 
 
962 aa  229  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  26.83 
 
 
910 aa  229  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 
932 aa  229  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  28.76 
 
 
1006 aa  227  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  28.66 
 
 
1111 aa  226  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  27.69 
 
 
853 aa  225  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  27.61 
 
 
984 aa  222  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  27.22 
 
 
892 aa  221  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  26.6 
 
 
868 aa  219  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  26.16 
 
 
852 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  25.56 
 
 
895 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  25.78 
 
 
895 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  25.67 
 
 
895 aa  211  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  28.04 
 
 
981 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  25.83 
 
 
895 aa  208  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  26.75 
 
 
901 aa  207  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  25.91 
 
 
902 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  25.67 
 
 
891 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  25.8 
 
 
955 aa  197  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  26.66 
 
 
956 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  26.72 
 
 
730 aa  197  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  26.66 
 
 
956 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  25.87 
 
 
850 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  25.87 
 
 
850 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  25.76 
 
 
850 aa  193  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  26.52 
 
 
975 aa  189  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  27.75 
 
 
906 aa  187  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  26.26 
 
 
922 aa  187  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  25.26 
 
 
855 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  25.54 
 
 
886 aa  186  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  27.64 
 
 
906 aa  184  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  26.1 
 
 
922 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  25.87 
 
 
843 aa  180  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  27.07 
 
 
928 aa  178  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  26.64 
 
 
926 aa  178  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  26.64 
 
 
926 aa  178  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  27.27 
 
 
928 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  26.66 
 
 
926 aa  177  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  26.86 
 
 
921 aa  177  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  28.05 
 
 
683 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  27.19 
 
 
683 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  26.95 
 
 
847 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  27.1 
 
 
811 aa  171  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  25.14 
 
 
843 aa  171  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  25.58 
 
 
613 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02060  Rhs element Vgr protein  59.31 
 
 
221 aa  169  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  26.6 
 
 
619 aa  168  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  28.98 
 
 
684 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  25.58 
 
 
618 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  25.04 
 
 
741 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  24.75 
 
 
890 aa  165  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  24.5 
 
 
837 aa  163  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0918871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>