More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03644 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 906 aa  1832    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  99.12 
 
 		 906 aa  1816    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  43.14 
 
 		 921 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  43.01 
 
 		 926 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  42.81 
 
 		 928 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  41.61 
 
 		 851 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  42.7 
 
 		 928 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  40.88 
 
 		 853 aa  598  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  42.3 
 
 		 926 aa  594  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  42.3 
 
 		 926 aa  594  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  39.41 
 
 		 927 aa  505  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  38.67 
 
 		 922 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1582  Rhs element Vgr protein  40.94 
 
 		 858 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.371781  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  37.94 
 
 		 922 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  36.26 
 
 		 902 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  31.33 
 
 		 956 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  31.33 
 
 		 956 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  31.26 
 
 		 955 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  32.24 
 
 		 871 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  32.76 
 
 		 869 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  32.03 
 
 		 875 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  31.67 
 
 		 908 aa  369  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  32.88 
 
 		 1019 aa  360  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  29.14 
 
 		 958 aa  350  8e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  31.26 
 
 		 910 aa  342  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  30.47 
 
 		 895 aa  337  7e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  31.95 
 
 		 855 aa  337  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  30.72 
 
 		 850 aa  336  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  30.34 
 
 		 895 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  31.6 
 
 		 842 aa  334  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  29.98 
 
 		 895 aa  331  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  30.14 
 
 		 911 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  31.37 
 
 		 1074 aa  327  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  30.8 
 
 		 853 aa  326  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  29.67 
 
 		 891 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  29.44 
 
 		 895 aa  325  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  29.75 
 
 		 892 aa  325  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  28.98 
 
 		 923 aa  321  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  30.44 
 
 		 1057 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  29.91 
 
 		 1059 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  30.29 
 
 		 850 aa  318  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  30.29 
 
 		 850 aa  318  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  30.56 
 
 		 1057 aa  317  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  30.68 
 
 		 1063 aa  316  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  29.43 
 
 		 852 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  30.17 
 
 		 850 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  30.44 
 
 		 1063 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  30.44 
 
 		 1063 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  31.14 
 
 		 853 aa  312  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  38.82 
 
 		 1019 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  41.91 
 
 		 509 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  29.93 
 
 		 853 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  28.92 
 
 		 1094 aa  302  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  28.52 
 
 		 957 aa  293  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  30.82 
 
 		 890 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  30.11 
 
 		 975 aa  283  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  27.7 
 
 		 868 aa  281  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  28.81 
 
 		 1048 aa  280  9e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  30.06 
 
 		 886 aa  279  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  30.19 
 
 		 730 aa  279  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  30.21 
 
 		 898 aa  276  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  28.93 
 
 		 979 aa  272  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  30.46 
 
 		 901 aa  271  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  31.42 
 
 		 847 aa  268  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  29.04 
 
 		 928 aa  266  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  28.07 
 
 		 862 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  27.83 
 
 		 862 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  29.07 
 
 		 968 aa  265  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  28.28 
 
 		 933 aa  258  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  30.11 
 
 		 918 aa  253  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  29.94 
 
 		 981 aa  250  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  28.65 
 
 		 1006 aa  249  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  29 
 
 		 962 aa  248  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  28.35 
 
 		 1111 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  28.7 
 
 		 1111 aa  243  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1111 aa  243  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  27.43 
 
 		 895 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  28.52 
 
 		 843 aa  241  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  27.59 
 
 		 1111 aa  239  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  30.2 
 
 		 920 aa  233  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  29.92 
 
 		 935 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  29.44 
 
 		 935 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  29.4 
 
 		 935 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  30.83 
 
 		 841 aa  231  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  29.4 
 
 		 935 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1606  Rhs element Vgr protein  29.4 
 
 		 935 aa  231  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  30.83 
 
 		 841 aa  231  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0498  Rhs element Vgr protein  29.4 
 
 		 935 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1580  Rhs element Vgr protein  29.29 
 
 		 935 aa  231  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  30.76 
 
 		 841 aa  230  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  30.59 
 
 		 838 aa  229  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  33.9 
 
 		 616 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  29.75 
 
 		 920 aa  228  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  27.24 
 
 		 843 aa  225  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  29.8 
 
 		 932 aa  224  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  28.81 
 
 		 984 aa  221  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  29.31 
 
 		 849 aa  221  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  28.41 
 
 		 947 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  27.75 
 
 		 811 aa  213  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  26.62 
 
 		 1114 aa  211  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>